近日,哈佛医学院Allegra A. Petti和Gavin P. Dunn、布列根和妇女医院Tanner Johanns联合在Cancer discovery期刊上发表题为Glioblastoma-infiltrating CD8+T cells are predominantly a clonally expanded GZMK+effector population的研究论文,...
近日,哈佛医学院Allegra A. Petti和Gavin P. Dunn、布列根和妇女医院Tanner Johanns联合在Cancer discovery期刊上发表题为Glioblastoma-infiltrating CD8+T cells are predominantly a clonally expanded GZMK+effector population的研究论文,使用多组学方法对脑胶质瘤患者的T细胞进行测序,发现典型的T细胞耗竭标志在高级别胶质...
Dunn、布列根和妇女医院Tanner Johanns联合在Cancer discovery期刊上发表题为Glioblastoma-infiltrating CD8+ T cells are predominantly a clonally expanded GZMK+ effector population的研究论文,使用多组学方法对脑胶质瘤患者的T细胞进行测序,发现典型的T细胞耗竭标志在高级别胶质瘤(HGG)的TIL中弱表达。值得注意的是,在...
在早期阶段,两名个体的CD8 T细胞均具有I型干扰素特征,并过表达与抑制途径相关的基因,如PRDM1。相比之下,晚期阶段具有相同抗原特异性的CD8 T细胞则表达了与自我更新相关的基因,如TCF7和IL7R,以及干细胞特性(GZMK)。将这些数据与公开的HIV特异性CD8 T细...
对于CD8+ T细胞亚群,治疗前高比例的CD8增殖T细胞和CD8 GZMB+细胞预示着对GOLP的良好反应,这些细胞也表现出较高的PDCD1表达。此外,CD8 GZMK+细胞的增加与GOLP治疗的良好反应和肿瘤缩小程度密切相关,且GZMK的高表达与iCCA患者的良好预后有关。 综上所述,CD8 GZMK+细胞可能在iCCA患者中起到保护作用。流式细胞术和...
使用UMAP进行无偏聚类发现,WT和Mfn2CKO小鼠中存在6个CD8 T细胞亚群(图2,G和H)。比较了WT和Mfn2CKO小鼠中每个簇的丰度(图2J和图S5D)。WT小鼠CD8 TIL的单细胞转录组学分析显示,Mfn2在增殖T细胞中的表达最高,而Mfn1在T细胞亚群中相对稳定。 分析结果还显示Mfn2缺失的细胞具有较低的细胞毒性基因(Gzmb和Gzmk)...
相比之下,晚期阶段具有相同抗原特异性的CD8 T细胞则表达了与自我更新相关的基因,如TCF7和IL7R,以及干细胞特性(GZMK)。将这些数据与公开的HIV特异性CD8 T细胞转录组数据集进行比较,结果显示早期阶段的CD8 T细胞特征与慢性进展者中的CD8 T细胞相似,而晚期阶段的CD8 T细胞则更类似于HIV-1感染自然控制者中的CD8 T细胞...
结果表明,scRNA-seq和WES数据不仅呈现了SLE中已知的B细胞和CD4+T细胞异质性,还发现PBMCs中的CD8+T淋巴细胞同样具有明显的异质性。 接下来,研究人员利用Monocle3揭示了CD8+T细胞从初级CD8_SELL细胞开始,通过以CD8_GZMK细胞为特征的中间状态,最终到达两个独立的终端谱系(终末分化T细胞,TEMRA),分别是CD8_GZMB和CD8_GZ...
为了明确炎症性结肠CD8+T细胞的调控网络,作者进行了基因共表达分析,对转录因子(TF)顺式调控的共表达基因进行活性评估,鉴定出273个活跃的TF活性相关circuits。层次聚类发现了只在特定T细胞亚群中表达的网络(图3A)。 通过伪时间分析绘制线性进化轨迹: 从初始T细胞 到记忆T细胞、组织驻留的T细胞(TRM)、GZMK+效应T细胞,最...
结果表明,scRNA-seq和WES数据不仅呈现了SLE中已知的B细胞和CD4+T细胞异质性,还发现PBMCs中的CD8+T淋巴细胞同样具有明显的异质性。 接下来,研究人员利用Monocle3揭示了CD8+T细胞从初级CD8_SELL细胞开始,通过以CD8_GZMK细胞为特征的中间状态,最终到达两个独立的终端谱系(终末分化T细胞,TEMRA),分别是CD8_GZMB和CD8_GZ...