1. 编辑 `~/.bashrc`(或 `~/.zshrc`)文件,将 CD-HIT 安装路径添加到 `PATH` 变量。 2. 使用 `source ~/.bashrc` 命令使改动生效。 3. 通过 `which cd-hit` 确认是否能正常访问 `cd-hit` 命令。 要将CD-HIT 的安装路径 /home/zxzhang/0_Tools/cdhit-4.8.1 写入到 Linux 环境变量中,使其...
(2)CD-HIT的安装目录为/opt/cd-hit/4.8.1,需要提前建立。 (3)使用的测试数据是双端测序数据,合并要用到pandaseq,可以参考使用pandaseq合并双端测序实战这篇文章安装。 安装 安装依赖: apt-get install zlib1g-dev 从GitHub上下载CD-HIT源码并编译安装: curl -OL https://github.com/weizhongli/cdhit/releas...
Cd-hit在虚拟机的安装与使用 1.下载网址:https://github/weizhongli/cdhit/releases 下载版本:cd-hit-v4.6.8-2017-1208 2.进入到安装目录:如 qiime@qiime-190-virtual-box:~/Desktop/Shared_Folder/cd-hit-v4.6.8-2017-1208$ 3.输入文件为fasta文件,输出文件为fasta/fna文件 ...
-n 2 for thresholds 0.4 ~ 0.5 只能完成在40%以上的序列相似性的聚类,假设要将阈值设置为30%的相似性则需要两次聚类并使用 脚本才能完成 cd-hit-2d的基本用法 用于比较两个数据库中的相似性序列,默认识别在 db2 中的序列和 db1 中的序列相似性高于某个阈值的序列,输入是两个 fasta 格式的文件,输出是 db2...
使用cd-hit对蛋白质或核酸序列进行聚类 转载自:https://huifangliu.github.io/2018/08/22/%E4%BD%BF%E7%94%A8cd-hit%E5%AF%B9%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B4%A8%E6%88%96%E6%A0%B8%E9%85%B8%E5%BA%8F%E5%88%97%E8%BF%9B%E8%A1%8C%E8%81%9A%E7%B1%BB/...
使用目的:protein sequence dataset 的去冗余(non-redundancy) 使用工具: cd-hit 在线网站 使用: input:fasta fi...
(1)本文基于Debian 11,安装使用的是CD-HIT 4.8.1。 (2)CD-HIT的安装目录为/opt/cd-hit/4.8.1,需要提前建立。 (3)使用的测试数据是双端测序数据,合并要用到pandaseq,可以参考使用pandaseq合并双端测序实战这篇文章安装。 安装 安装依赖: apt-get install zlib1g-dev ...
外国原版《100%MegaHitz94》音乐CD,碟片品好轻微使用痕。类型: 大众加价 统一编号: au36614425 店内编号:24011402 品种: 音乐CD 属性: 乐器曲CD,标准型光盘 ,散曲合辑,90-99年,语种不详 ,,, ,,, , 简介: 小店坚守诚信为本,朋友们看好再拍,品相、版别看图自定。挑剔者慎入。所售CD均经过清洁除尘...
攻击力2568% 每hit觉醒 暗影之手改为火属性背后攻击造成900%额外伤害觉醒 火焰核心灰烬自动释放火焰核心灰烬造成200%的火焰核心伤害总计15000% 该技能伤害觉醒 移形换影CD2.6s与翻滚共享CD如果你成功躲避敌人的攻击 下个技能伤害提升1000%仅限于消耗MP的技能觉醒 致残惩罚者...
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