GWAS catalog数据下载, 视频播放量 18017、弹幕量 4、点赞数 183、投硬币枚数 86、收藏人数 603、转发人数 112, 视频作者 玻璃心up主, 作者简介 关注我会自动回复我的Vx,相关视频:使用GWAS Catalog整理下载链接,UK Biobank数据申请流程及下载方法,全基因组关联分析(GWA
第一步:确定你需要的数据 📊 首先,你需要确定你要下载的具体数据。你可以从文献中引用到的pmid号,或者从GWASCatalog的汇总表格中找到表型,然后得到对应的GCST id号。这个步骤很重要,因为只有知道了具体的id号,你才能找到对应的数据。 第二步:搜索pmid号或GCST id 🔍 接下来,打开网页,输入你的pmid号或者GCST...
首先,进入GWAS catalog的官网(https://www.ebi.ac.uk/gwas/),点击Summary statistics(如下图所示) 进入Summary statistics后点击Available studies(如下图所示) 最后,你将进入如下界面(链接:https://www.ebi.ac.uk/gwas/downloads/summary-statistics) 该界面主要由三部分组成 第一块是 “List of published studi...
在孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究中,对于暴露数据我们只需要那些显著的SNP信息,这样的信息在各种GWAS数据库中都是很容易获取的。但是,关于结局的数据,由于需要SNP和结局不相关,所以很多时候这种不显著的结果无法直接从文章或者数据库中查询到,这时候我们需要下载完整的GWAS summary数据了,这种数据一般包含上...
通过GWAS Catalog的官网,用户可以方便地进行检索、查询和下载对应的信息。常用的功能模块包括: Search GWAS Catalog的搜索功能非常强大,用户可以根据多种条件进行检索,包括publications(文献)、variants(变异位点)、traits(性状)、genes(基因)和region(区域)等。以突变位点rs7329174为例,输入关键词后,搜索结果将显示该位点...
GWAS Catalog是EBI旗下的一个数据库,收录了公开发表的GWAS分析结果,截止2019-11-21,收录了16万个SNP位点和疾病之间的关联信息,更多信息汇总如下 通过官网,可以方便的检索,查询和下载对应的信息,常用的有以下3个模块 1. Search 可以根据以下多种条件进行检索 ...
研究者可通过访问NHGRI GWAS Catalog官网(http://www.ebi.ac.uk/gwas/)搜索,分析和下载特定表型的GWAS结果。 Catalog stat 到2017-06-26,网站汇总了: · 2999 publications · 31781 SNPs · 37401 unique SNP-trait associations · Genome assembly GRCh38.p10 · dbSNP Build 149 · Ensembl Build 89接下来...
GWAS Catalog 是一个收录全基因组关联研究(GWAS)结果的公开数据库,旨在为研究人员提供与人类复杂性状和疾病相关的遗传变异信息
GWAS Catalog 在孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)研究中,对于暴露数据我们只需要那些显著的SNP信息,这样的信息在各种GWAS数据库中都是很容易获取的。但是,关于结局的数据,由于需要SNP和结局不相关,所以很多时候这种不显著的结果无法直接从文章或者数据库中查询到,这时候我们需要下载完整的GWAS summary数据了,这种...
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