1. SpCas9(Streptococcus pyogenes Cas9):SpCas9是最早被发现和应用的Cas9变体之一,也是目前应用最广泛的一种。SpCas9具有高度的特异性和基因编辑效率,被广泛用于各种模式生物体和细胞类型的基因编辑研究。然而,SpCas9的分子大小较大,限制了其在一些特定应用场景下的使用。 2. SaCas9(Staphylococcus aureus Cas9):与Sp...
包括经典的化脓性链球菌Cas9的变体(SpCas9)在内不同的Cas酶可识别不同的PAM序列,但基因组的大部分仍然无法设靶编辑或更容易产生脱靶突变。例如,SpCas9和SaCas9(来自金黄色葡萄球菌)所识别的PAM序列多含鸟嘌呤/胞嘧啶(G/C-rich),因此利用已报导的碱基编辑系统无法在腺嘌呤/胸腺嘧啶富集(A/T-rich)区域进行精准碱...
通过进化获得了一个SlugCas9变体SlugCas9-NNG,可以识别NNG PAM。检测了SlugCas9-NNG在人类细胞中的特异性,结果表明其特异性优于SpCas9,但略低于高特异性的SpCas9-HF1变体。测试了SlugCas9-NNG在多个靶位点的编辑效率,结果显示其可以有效编辑NNGN PAM的靶位点。将SlugCas9-NNG改造为腺嘌呤编辑器SlugABE-NNG,用于...
包括经典的化脓性链球菌Cas9的变体(SpCas9)在内不同的Cas酶可识别不同的PAM序列,但基因组的大部分仍然无法设靶编辑或更容易产生脱靶突变。例如,SpCas9和SaCas9(来自金黄色葡萄球菌)所识别的PAM序列多含鸟嘌呤/胞嘧啶(G/C-rich),因此利用已报导的碱基编辑系统无法在腺嘌呤/胸腺嘧啶富集(A/T-rich)区域进行精准碱...
Nat Commu:最安全的Cas9编辑变体Cas9TX | #基因编辑 PBJ:利用基因编辑技术抑制早期赤霉素合成相关基因创造玉米理想株型 | #基因编辑 Genome Biology:高分辨率高灵敏度的微生物组测序技术 | #微生物测序 Bioresource Technology :耐碱性嗜盐菌生物合成平台 | #合成生物 Briefings in Bioinformatics: 基于深度图卷积的大...
PAM序列在我们的DNA中也很常见,因此CRISPR-Cas9已被用于编辑人类基因组,但是有一定的限制性,不接近PAM的基因不能作为靶点。没有一个相邻、可识别的PAM序列,Cas酶将无法识别或成功附着并切割所需的DNA片段。 包括经典的化脓性链球菌Cas9的变体(SpC...
该研究将Variant No.1与国际上两个知名的spCas9变体进行了比较,表明Variant No.1可以在保持高效在靶剪切率的同时,大幅度降低脱靶效率,尤其是在在靶剪切效率方面的表现较为突出。 综上所述,该研究成功开发出了可以保持高效的在靶剪切效率的同时大幅度降低脱靶率的基因编辑工具spCas9的优秀变体Variant No.1。
科技日报讯 (通讯员衣晓峰 朱玉威 记者李丽云)记者从哈尔滨工业大学获悉,该校生命学院教授黄志伟课题组完成的一项课题《高保真SpCas9变体的结构基础》,日前发表在最新一期国际期刊《细胞研究》上。该成果不仅首次揭示了高保真的Cas9基因编辑系统的分子机制,而且为改造SpCas9以及其他Cas核酸内切酶,使之成为更高效、更特异...
Cas9TX能抑制基因编辑过程中染色体易位、大片段缺失等染色体结构异常的产生,将CRISPR-Cas9基因编辑的安全性大大提高,其编辑过程中的DNA损伤被降低到与目前被认为最安全的碱基编辑器(Base Editor)相当的水平。Cas9TX可能是目前最为安全的CRISPR-Ca...
为了突破这种限制,结构引导的蛋白定向进化方法得到的一些SpCas9变体,如SpCas9 VQR和SpCas9 VRER,分别识别NGA和NGCG作为PAM序列; 4.在这项研究中,研究人员设计SpCas9新变体,设计的思路是减小Cas9蛋白对NGG中第3个碱基G的偏好性,最终得到识别NG作为PAM序列的SpCas9-NG新变体,将扩大Cas9蛋白的作用范围。