crRNA/gRNA 与Cas12a结合,形成功能性复合物(functional complex),被目标序列特异性激活。目标序列一般是经过特异性扩增(PCR,RPA或LAMP均可)。 常用的Cas12a有AsCas12a (from Acidaminococcus) 和 LbaCas12a(f…
crRNA序列被延伸以包括在一端与锚链杂交并且在另一端与延伸的crRNA杂交的摆臂。crRNA和Cas12a形成RNP复合物,该复合物组装在AuNP支架上。(b)响应于200 pM miRNA,实时监测由CRISPR纳米机器产生的荧光。(c) 凝胶电泳表征30 nt底物及其被反式切割的产物。DNA和RNA分别用于激活溶液中的CRISPR纳米机器或游离的CRISPR RNP。
crRNA的主要特征是:1. 包含导航序列、SPACER序列和3'超可变端。导航序列用于与CRISPR相关蛋白结合;SPACER序列来源于入侵核酸,包含20-30个核苷酸,用于识别目标序列;3'超可变端影响crRNA的稳定性。2. SPACER序列的来源决定了crRNA的靶向特异性。不同的SPACER序列可以识别不同的入侵核酸或不同的目标位点。3. crRNA的表达...
2类CRISPR-Cas系统包括剩余的10%几乎只存在于细菌中,并组装成一个核糖-核蛋白复合物,由crRNA与Cas蛋白组成,crRNA包含靶向特定DNA序列的信息。 目前所流行的Cas9与Cas12a系统均属于2类,CRISPR-Cas12a为一种由crRNA所引导的内切酶,是一种RNA引导的系统,被归类为...
crRNA序列被延伸以包括在一端与锚链杂交并且在另一端与延伸的crRNA杂交的摆臂。crRNA和Cas12a形成RNP复合物,该复合物组装在AuNP支架上。(b)响应于200 pM miRNA,实时监测由CRISPR纳米机器产生的荧光。(c) 凝胶电泳表征30 nt底物及其被反式切割的产物。DNA和RNA分别用于激活溶液中的CRISPR纳米机器或游离的CRISPR RNP...
Cas12a的特异性是由crRNA和DNA靶标之间的互补性、DNA靶标旁边的原间隔短回文序列邻近基序(protospacer adjacent motif,PAM)两个主要因素决定。尽管Cas12a的特异性已经被广泛研究,但许多体外研究是在高镁离子浓度下进行的,这可能与细胞内实际的游离Mg2+浓度不一致。为了解决这个疑惑,研究人员通过在一系列Mg2+浓度下...
Cas12蛋白只需要识别crRNA就能有效切割单链DNA和双链DNA。Cas12蛋白的RuvC和核酸酶叶(NUC)结构域具有裂解活性。与Cas9相同,Cas12a在PAM(5’-TTTV-3’, V为A/C/G)序列旁边存在一个潜在靶点,一旦与Cas12相遇,就可以启动R-loop,在crRNA和目标DNA链之间形成碱基对杂交,匹配目标序列的1~17个碱基对,形成R...
这些CRISPR-Cas系统通过CRISPR RNA(crRNA)指导,识别外源核酸靶标,并通过RNA或DNA的降解诱导细胞休眠或死亡,从而实现免疫防御。Cas12a作为一种核酸酶,依赖T-Rich的PAM序列识别靶标DNA片段,并在该位点产生交错双链断裂。与Cas9相比,Cas12a...
2. crRNA是处理过的RNA分子,含有与靶DNA互补的序列,可以特异性识别靶DNA。多个crRNA可以成簇,以提高靶向效率。3. 在不存在靶DNA的情况下,cas12a的核酸酶活性是抑制的。crRNA与cas12a结合后,也不会激活其酶活性,维持不活性状态。4. 当crRNA结合的cas12a与靶DNA发生碱基配对时,cas12a的核酸酶域会被激活,对...
而且,这种 crRNA 可直接从前体 crRNA 加工生成,在多重基因编辑场景中表现得游刃有余,科研人员能够借此灵活操控多个基因,实现复杂的基因编辑任务。论及 Cas12a 的独特优势,更是令人瞩目。无需 tracrRNA 的特性,让 RNA 递送复杂度直线下降,在植物和原代细胞实验中优势尽显,极大地拓宽了应用边界。黏性末端切割...