利用农大399/郑麦103的F2:3分离群体,通过田间成株期条锈病抗性鉴定分别构建抗、感混合池进行RNA-Seq,经过BSR-Seq分析快速确定了郑麦103中抗条锈病基因可能位于2BS和7BL染色体区段,并筛选出多个可能与抗条锈病基因相关连的SNP位点,用于开发分子标记。经多态性分子标记筛选和进行分离群体验证,证实郑麦103的抗条锈病基...
GATK官方RNA-seq calling流程 最新版的BSR分析流程 流程参考 WT 3个单株,混池。三个技术重复。 NS (实验组) 3个单株,混池。三个技术重复。 3个数量有点少,就暂且练习BSR吧。 小麦的BSR BSR和BSA的比对方式不一致。 基于DNA水平的重测序,可以测到所有的碱基变化情况,需要整个基因组比对。
聚焦于BSR-seq分析，此技术基于两个极端混池的转录组测序数据，通过ED方法进行统计计算。在数据处理的前期阶段，首先进行比对和排序。接着，使用bcftools工具进行变异检测，确保数据质量。变异检测后，通过ED方法进行统计计算，并绘制出相应的图表，以直观呈现分析结果。团队成员可通过加入学习交流群，共同探讨...
进行BS-seq数据初步分析和预处理;结合不同研究背景和实验需求对基因表达量进行深入探讨和评估;开展差异表达基因和基因调控机制的分析研究;同时完成整个数据分析流程的梳理和优化。 ,理想股票技术论坛
小麦BSRSeq基因定位技术体系的建立和应用与粗山羊草3DS染色体 臂序列分析 小麦和粗山羊草都是重要的农作物,在粮食和畜牧业中扮演着重要的 角色。随着分子生物技术的不断发展,对小麦和粗山羊草的基因组学 研究也越来越重要。其中,BSRSeq基因定位技术和3DS染色体臂序 列分析在作物基因定位和染色体结构研究中具有重要意义...
为了研究甘蔗脱叶性相关的主效、稳定基因，本研究采用BSR-Seq 技术，从‘ROC25’ב云蔗89-7’的F1后代中选取极端难脱叶品系和极端易脱叶品系的+6叶位叶鞘离区，分别构建混池，并和亲本一起进行RNA 转录组测序分析，共得到60.46 Gb 的有效片段，4个样品的Q30值均在93%以上，GC 含量都大于51%，与参考基因...
对Pm2位点进行了外显子测序分析,结合前期我们已经完成的BSR-Seq分析结果,在Pm2精细定位区间内,发现了10个基因在4个突变体中均发生了错义突变,其中4个基因与BSR-Seq得到的差异表达基因重合,说明这4个基因可能参与了该位点介导的白粉病抗性,目前我们正在对这4个基因进行功能分析和互作研究,以解析不同基因共同参与Pm2...
进行BS-seq数据初步分析和预处理;结合不同研究背景和实验需求对基因表达量进行深入探讨和评估;开展差异表达基因和基因调控机制的分析研究;同时完成整个数据分析流程的梳理和优化。 ,理想股票技术论坛
本研究基于BSR-Seq技术对甘蔗脱叶相关的主效、稳定遗传的候选基因进行了筛选,并利用荧光定量分析对极端材料的+ 1～+7叶叶鞘离区部位进行了不同群体的分析,验证基因是否在不同群体中都具有稳定遗传的效应。通过对稳定遗传基因的生物信息学分析了解该基因的特点,为甘蔗脱叶的分子研究提供理论基础。
利用农大399/郑麦103的F2:3分离群体,通过田间成株期条锈病抗性鉴定分别构建抗、感混合池进行RNA-Seq,经过BSR-Seq分析快速确定了郑麦103中抗条锈病基因可能位于2BS和7BL染色体区段,并筛选出多个可能与抗条锈病基因相关连的SNP位点,用于开发分子标记。经多态性分子标记筛选和进行分离群体验证,证实郑麦103的抗条锈病基...