bsr-seq基本原理 bsr-seq全称为Barcode Splitting Reads Sequencing,是一种高通量测序技术。其基本原理是将待测样本分成多个条码组,每组样本带有唯一的DNA条码。每个条码组内的样本共同被随机断裂成小片段,这些小片段则被混合在一起进行测序。 在测序后,使用计算机程序将不同小片段的DNA序列根据其含有的条码区域进行...
本发明的小麦BSR-Seq基因定位的方法,不依赖于参考基因组序列、低成本、快速、精度高。 本发明将下一代转录组测序技术(转录组测序,RNA-Seq)和混池技术(Bulked Segregant Analysis,BSA)相结合解决相关问题。首先,利用小麦测序草图序列(International Wheat Genome Sequencing Consortium 2014)作为参考序列,虽然其基因组覆盖...
这两种酶分别催化EGCG的3″-位置和4″-位置进行O-甲基化,生成EGCG3″Me和EGCG4″Me。研究人员通过BSR-Seq分析,进一步研究了CsFAOMT1和CsFAOMT2在不同茶叶组织和种质中的表达水平与相应O-甲基化儿茶素含量之间的关系,进一步揭示了结构特征和催化机制。 图1 O-甲基化儿茶素的生物合成途径 研究材料与方法 1.实验...
利用BSR-Seq定位小麦品种郑麦103抗条锈病基因YrZM103
BSR-seq 基于2 个极端混池的转录组测序数据进行 BSA 分析,使用ED方法进行统计计算。 数据准备 参考基因组、两个极端混池 比对、排序、去除重复 hisat2-build genome.fasta genome # 构建参考基因组samtoolsfaidx genome.fasta samtools dict -o genome.dict genome.fasta ...
BSRSeq基因定位技术和3DS染色体臂序列分析在小麦和粗山羊草等 作物的研究中具有重要的应用前景和未来发展方向。随着分子生物技 术的不断进步,这两种技术将不断完善和提高,为作物遗传育种和染 色体结构变异研究提供更加精确和高效的技术手段。同时,随着全球
（2）叶绿素和类胡萝卜素的测定，表皮蜡质的测定 （3）qRT-PCR 结论：在杂交种群上使用BSR-seq消除了遗传背景和个体差异的某些干扰作用，从而帮助本研究集中研究了控制黄叶茶树叶片颜色变化的关键基因。注：算是BSR-seq在茶学研究中的第一次尝试。从BSR-seq的定义中可以看出，本研究只做了后半部分，而对于SNP和...
聚焦于BSR-seq分析，此技术基于两个极端混池的转录组测序数据，通过ED方法进行统计计算。在数据处理的前期阶段，首先进行比对和排序。接着，使用bcftools工具进行变异检测，确保数据质量。变异检测后，通过ED方法进行统计计算，并绘制出相应的图表，以直观呈现分析结果。团队成员可通过加入学习交流群，共同探讨...
本发明公开了一种小麦BSRSeq基因定位的方法,包括混池的构建和测序,质量变异挖掘,与目的基因紧密连锁的转录本的筛选,分子标记开发和定位等步骤.将下一代转录组测序技术(转录组测序,RNASeq)和混池技术(Bulked Segregant Analysis,BSA)相结合,首先利用小麦测序草图序列作为参考序列;其次采用下一代测序技术高通量挖掘转录...
大家好，我现在有个F2群体（单基因控制），想用BSR-Seq初定位，但是得干旱处理后才能看到表型，我想问...