bsr-seq全称为Barcode Splitting Reads Sequencing,是一种高通量测序技术。其基本原理是将待测样本分成多个条码组,每组样本带有唯一的DNA条码。每个条码组内的样本共同被随机断裂成小片段,这些小片段则被混合在一起进行测序。 在测序后,使用计算机程序将不同小片段的DNA序列根据其含有的条码区域进行排序和比对,将同一条...
❝ 「因业务拓展,想组建一个数据分析团队(目前已有RNA-Seq、Chip-Seq、重测序与群体遗传、基因家族、比较基因组、宏基因组、微生物多样性16s/18s/ITS方向专业人员),欢迎有各种数据分析基础的朋友加入我们! ——Bioinfor 生信云」 ❞ BSR-seq 基于2 个极端混池的转录组测序数据进行 BSA 分析,使用 ED方法进行...
利用BSR-Seq定位小麦品种郑麦103抗条锈病基因YrZM103
BSRSeq基因定位技术和3DS染色体臂序列分析在小麦和粗山羊草等 作物的研究中具有重要的应用前景和未来发展方向。随着分子生物技 术的不断进步,这两种技术将不断完善和提高,为作物遗传育种和染 色体结构变异研究提供更加精确和高效的技术手段。同时,随着全球
（1）Bulked Segregant RNA-seq （BSR-seq）：将转录组测序与集群分离分析相结合，在转录组范围内开发SNPs，筛选与性状紧密连锁的SNPs，进行功能基因的定位，同时进行基因差异表达分析等转录组常规分析的技术。每个类别混合建库，转录组测序 （2）叶绿素和类胡萝卜素的测定，表皮蜡质的测定 （3）qRT-PCR 结论：在杂交...
图2 通过BSR-Seq和Q-PCR确定控制高苦茶碱性状和低咖啡因性状的关键候选基因 3.TcS的亚细胞定位和体内功能鉴定 35S-TcS-GFP的荧光信号可在细胞核和细胞质中检测到。研究人员将1,3,7-三甲基尿酸注入到t0代TcS/EV转基因烟草叶片中,发现TcS转基因植物吸收1,3,7-三甲基尿酸后,可产生苦茶碱,而对照组不能合成苦茶...
聚焦于BSR-seq分析，此技术基于两个极端混池的转录组测序数据，通过ED方法进行统计计算。在数据处理的前期阶段，首先进行比对和排序。接着，使用bcftools工具进行变异检测，确保数据质量。变异检测后，通过ED方法进行统计计算，并绘制出相应的图表，以直观呈现分析结果。团队成员可通过加入学习交流群，共同探讨...
本研究基于BSR-Seq技术对甘蔗脱叶相关的主效、稳定遗传的候选基因进行了筛选,并利用荧光定量分析对极端材料的+ 1～+7叶叶鞘离区部位进行了不同群体的分析,验证基因是否在不同群体中都具有稳定遗传的效应。通过对稳定遗传基因的生物信息学分析了解该基因的特点,为甘蔗脱叶的分子研究提供理论基础。
利用BSR-Seq将小麦品种郑麦103的抗条锈病基因YrZM103定位在7BL染色体末端18.7cM遗传区间,比较遗传学图谱表明YrZM103是与Yr52、YrZH84和YrC591不同的抗条锈病新基因。该研究为郑麦103的推广和育种利用以及抗条锈病基因的精细定位和分子标记辅助选择育种奠定了基础。
通过BSR-Seq 技术开发了6个与YrZM103紧密连锁的分子标记, 将YrZM103定位于染色体臂7BL 分子标记ZM215和ZM221之间, 遗传距离分别为11.8 cM 和6.9 cM 。利用7BL 染色体上与其他已知抗条锈病基因紧密连锁的分子标记进行比较作图, 发现YrZM103是不同于7BL 末端其他抗条锈病基因的新基因。关键词: 郑麦103; 条...