☑ 与遗传图谱结果相结合，基于表型数据，进行QTL定位，与BSA结果相结合；☑ 开发SNP或者InDel分子标记，通过大群体性状与分子标记的共分离缩小候选区间；☑ 结合RNA-seq结果，选取具有显著差异表达的或某显著富集通路上的基因作为候选基因。☑ 结合相关性状的文献报告，基于序列同源、基因的功能或者相关突变类型（...
本研究对CTMD和RNRF差异较大的菊花‘Candy’和菊花‘225’亲本以及305个F1代杂交群体进行了SLAF-seq简化基因组测序,测序深度分别为57.48X,59.69X和23.52X,通过分析鉴定得到了234,648个高质量SNPs,利用高质量的SNPs构建了一套总图距为4301.5cM、平均图距为0.76cM的菊花高密度遗传图谱,为菊花花型遗传育种研究提供了...
☑ 结合RNA-seq结果,选取具有显著差异表达的或某显著富集通路上的基因作为候选基因。 ☑ 结合相关性状的文献报告,基于序列同源、基因的功能或者相关突变类型(如EMS),锁定候选基因; 后续验证方法总结有: ☑ 将候选标记转化为CAPs(dCAPs)、凝胶电泳或者一代测序进行验证; ☑ 基于RNA-seq的差异表达分析,看基因是...
近日,《生物技术通报》在线发表了《基于BSA-seq和RNA-seq挖掘水稻株高相关QTL》文章。本研究使用籼稻油占8号和广西普通野生稻构建的CSSL群体以及现代分子生物学技术,对广西普通野生稻进行研究,通过二代测序和混池分析方法,鉴定广西普通野生稻基因组...
·研究报告· 生物技术通报 BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2023, 39(8):173-184 基于 BSA-seq 和 RNA-seq 挖掘水稻株高相关 QTL 吴元明1 林佳怡1 柳雨汐1 李丹婷2 张宗琼2 郑晓明3,4,5 逄洪波1 (1. 沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110034 ;2. 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所 广西...
·研究报告· 生物技术通报 BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2023, 39(8):173-184 基于 BSA-seq 和 RNA-seq 挖掘水稻株高相关 QTL 吴元明1 林佳怡1 柳雨汐1 李丹婷2 张宗琼2 郑晓明3,4,5 逄洪波1 (1. 沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110034 ;2. 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所 广西...
3.36 Mb)、18号染色体44,366,115~54,297,600 bp区间(总长为9.93 Mb)等区域内。将BSA-Seq结果与转录组测序结 果进行联合分析发现, 有12个基因相关联; 最后, 结合生物信息学分析、候选基因的表达模式和基因的同源注释, 锁 定CNGC4、WRKY16转录因子、AAP7、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、ZPR1B等12个基因为控制豆...
Hill J T , Demarest B L , Bisgrove B W , et al. MMAPPR: Mutation Mapping Analysis Pipeline for Pooled RNA-seq[J]. Genome Research, 2013, 23(4):687-697.
将BSA-Seq结果与转录组测序结果进行联合分析发现, 有12个基因相关联; 最后, 结合生物信息学分析、候选基因的表达模式和基因的同源注释, 锁定CNGC4、WRKY16转录因子、AAP7、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、ZPR1B等12个基因为控制豆卷叶螟性状相关的候选基因。本研究结果不仅为解析大豆抗豆卷叶螟的分子机理奠定重要的基础, 也...
氮掺杂碳酸氧铋(N-Bi_2O_2CO_3,N-BOC)/硒化镉量子点(CdSeQDs) PbSe量子点近红外量子点 Ag掺杂HgS量子点 pH调谐的近红外量子点(Ag掺杂HgS) CdTe的II型水溶性近红外量子点 高质量、水溶性、Ⅱ型CdTe/CdSe核壳近红外量子点 CdTe/CdS@ZnS-SiO2近红外量子点 ...