三杂环结构与 BD1 乙酰赖氨酸的结合口袋处的 Asp144 形成了氢键,而在 BD2 蛋白中该位置是 His437 残基,该位点在 BET 家族中并不是保守的,这也解释了 olinone 对 BET 家族中的其他 BD1 蛋白产生选择性的原因。
咪唑环4-位上的小位阻乙基指向Leu385,并且由于乙基的空间位阻效应,分子内的4-氟-2,6-二甲基苯基发生了偏转(图2C),从而由于BD2/BD1的“Val439/Ile146”差异进一步提高了BD2选择性。但是,与已报道的BRD4 BD2多肽选择性抑制剂情...
BRD4 含有两个溴结构域模块(BD1和BD2),参与乙酰赖氨酸识别,将BRD4连接到染色质上;HAT(histone acetyl transferase)结构域具有组蛋白乙酰转移酶的作用,可乙酰化组蛋白中的赖氨酸残基;其还具有丝氨酸激酶活性,参与RNA pol II(RNA聚合酶II)介导的转录,从而影响细胞的生理功能;C端结构域(a C-terminal mot...
是一种转录和表观遗传调节因子,在胚胎发生和癌症发展过程中起着关键作用。作为溴结构域和末端外结构域 (BET) 家族的成员,BRD4 的特征在于具有两个串联溴结构域(BD1、BD2)。BDs 结合靶蛋白(包括组蛋白)上的乙酰化赖氨酸残基,因而对具有多个乙酰化残基的蛋白质的亲和力更高。BRD4与染色质上的超乙酰化组蛋白区域相...
作为溴结构域和末端外结构域 (BET) 家族的成员,BRD4 的特征在于具有两个串联溴结构域(BD1、BD2)。BDs 结合靶蛋白(包括组蛋白)上的乙酰化赖氨酸残基,因而对具有多个乙酰化残基的蛋白质的亲和力更高。BRD4与染色质上的超乙酰化组蛋白区域相互作用,在转录活性调控元件上积累并在起始和延伸步骤中促进基因转录。
两种溴结构域同时结合至DCAF16,具有代表位于DCAF16、BD1和BD2之间的一个IBG1分子的单一连续密度(图4b)。尽管 IBG1 的 JQ1 部分与 BD2 的乙酰赖氨酸口袋结合,但E7820 部分意外地与 BD1 的等效口袋结合。IBG1 的 E7820 部分的结合模式与已与 BD1 共结晶的其他含磺酰胺 BET 抑制剂很好地重叠,其中氰基的氮...
研究团队从化合物ABBV-075出发,旨在进行结构修饰成选择性抑制BD2的分子。其中,ABBV-075对BD1和BD2的亲和常数分比为2.8nM和1.3nM,没有选择性的差异。首次优化:基于化合物ABBV-075的共晶实验,研究团队首先在吡咯烷酮的2位和砜基进行了初步的构效研究,发现化合物18取得了更高的BD2选择性抑制。第二次优化:...
两段N端串联BRD (BD1和BD2,显示为蓝色)与乙酰化识别有关;一个额外的蛋白-蛋白相互作用区域(ET,显示为橙色);BRDT以及BRD4的长突变体(BRD4L)都包含一个与正向转录延长因子(P-TEFb)作用的C-端区域(CTM,显示为深蓝色);保守区域(A,显示为绿色;B,显示为深红色)以及一段富含丝氨酸-谷氨酸-天冬氨酸的区域(SEED,...
揭示BRD4蛋白的新发现:癌症治疗与多领域影响 BRD4,作为转录和表观遗传调控领域的关键角色,其在胚胎发育和癌症进展中扮演着决定性角色。作为BET家族的成员,BRD4独特的结构由两个串联的溴结构域(BD1和BD2)构成,这些结构域赋予它识别并结合染色质上乙酰化赖氨酸的能力,尤其是那些富含这类修饰的蛋白质...
分析ASFV在3D4/21-BRD4-BD1/2细胞系与WT细胞系之间的复制差异.首先,以家猪基因BRD4-BD1/2为靶标,构建了含有3x Flag标签的重组质粒pLVX-IRES-puro-3x Flag-BRD4-BD1/2,并将其与质粒pMD2.G和pSPAX2共同转染至HEK-293T细胞进行慢病毒包装,获得具有感染能力的慢病毒.使用慢病毒感染3D4/21细胞...