Brain RNA-Seq数据库:http://web.stanford.edu/group/barres_lab/brain_rnaseq.html 应用1: 输入基因名可查询该基因在不同细胞类型的表达情况,例如输入TPPP,点击Search得到结果与Cell文章一致: 众所周知,Iba1是小胶质细胞的特异性标志物,在GeneCards(https://www.genecards.org/)输入Iba1 可知其基因名为Aif1。
GO富集分析和KEGG通路分析表明,下调基因主要与突触、钙离子信号通路和神经相关的配体受体反应有关。 图5 RNAseq分析提示Maf1调控下游基因Grin1参与钙信号通路和突触功能 CUT&Tag实验进一步探讨了Maf1在AD中调节突触重塑的机制(图6)。GO分析...
从蛋白水平来看,R62H、R62L、T96K变异导致TREM2的Δe2异构体增加1.5-2倍,这种异构体虽然保留了与TREM2相应配体结合的关键结构但缺失活性,R62C和T96R变异造成的影响则更为显著。 研究者们利用三组独立队列研究的RNA-Seq数据验证表明,与其他人相比,TREM2R62H携带者大脑中的Δe2异构体增加1.8倍,不同大脑区域...
1.人类运动神经发生过程中核和细胞质部分的高覆盖率RNA-seq数据 人类运动神经发生过程中的时间分辨细胞分离和RNA测序揭示了ALS中广泛的异常细胞质IR。研究表明异常的胞浆IR在肌萎缩侧索硬化症中是一种普遍的现象,产生于运动神经发生的早期阶段。 图1:人类运动神经发生过程中的时间分辨细胞分级分离和RNA测序揭示了ALS中...
BrainRNA-SeqProfilingoftheMucopolysaccharidosisTypeIIMouse 系统标签: seqbrainrnamouseprofiling多糖 InternationalJournalof MolecularSciences Article BrainRNA-SeqProfilingoftheMucopolysaccharidosis TypeIIMouseModel MarikaSalvalaio 1,2 ,FrancescaD’Avanzo 1,2, *,LauraRigon 1,2 ,AlessandraZanetti 1,2 , Mic...
RNA-sequencing (RNA-seq) is a powerful technique to investigate the complexity of gene expression in the human brain. We used RNA-seq to survey the brain transcriptome in high-quality postmortem dorsolateral prefrontal cortex from 11 individuals diagnosed with bipolar disorder (BD) and from 11 ...
( 2014 ). RNA-seq of the ageing brain in the short-lived fish N. furzeri – conserved pathways and novel genes associated with neurogenesis . Aging Cell 13 , 965 – 974 .Baumgart M, Groth M, Priebe S, Savino A, Testa G, Dix A, et al. RNA-seq of the aging brain in ...
空间转录组是从组织切片层面上解析RNA-seq数据的新技术,而数据的分析方法却与常规的单细胞转录组有很多相似的地方。在之前的微信文章如、已介绍过如何使用Seurat分析单细胞转录组数据,今天再为大家分享一下Seurat分析空间转录组数据的方法。 本文的范例数据下载链接: ...
跟着18篇CNS文章学单细胞多组学分析(含空间转录组、chipseq、RNAseq、Atacseq外显子)常年 开班 火热的Chat-GPT结合万用模版英文论文写作专为您论文而设计 12月22-24 线上 2024年国自然构思与撰写经验分享会,国自然特训营(1.13-16/1. 27-30 四天线下会议) ...
The brain data base [https://web.stanford.edu/group/barres_lab/brain_rnaseq.html] or GSE 52564 was used to identify the cell types where genes were mainly located. The datasets generated during and/or analyzed during the current study are available from the corresponding author on reasonable ...