CC(Cellular Component)即细胞组分,描述基因产物在细胞内的位置或结构,如细胞核、线粒体、细胞膜、细胞质等。CC提供了基因产物在细胞结构和组织中的定位信息,有助于揭示基因在细胞内的空间分布和功能区域。每个大类下面又有许多小层级,层级数字越大,功能描述越细致。 MF(M...
1. BP(Biological Process)代表生物过程,涉及基因或蛋白质参与的生物学活动,例如细胞代谢、信号传导等。2. CC(Cellular Component)指的是细胞组成,描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构,例如核内、线粒体等。3. MF(Molecular Function)指的是分子功能,表示基因或蛋白质所具有的化学活性或能力...
BP(BiologicalProcess)、CC(CellularComponent)和MF(MolecularFunction)是基因功能分类的重要概念。BP指生物过程,描述基因或蛋白质参与的生物学活动,如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成,用于描述基因或蛋白质所在位置和结构,如核内、线粒体等。MF指分子功能,表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力...
GO富集分析主要涉及三个分支:生物过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。下面将详细解释这三个分支在GO富集分析中的含义、应用方法,并提供相关的分析步骤、工具推荐及注意事项。 一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的...
GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富...
http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_GO_term_bp_cc_mf_left_right_bar_plot_191 图1.可视化页面 2,示例数据 点击右侧“示例数据”链接下载excel格式的示例数据。 示例数据(仅供参考)包括4列: 第1列是GO term名字; 第2列是分类(分类名必需是Biological process、Cellular component、Molecular function...
要创建可视化图,首先,打开一个专门的绘图页面,如bioinformatics.com.cn/p...,页面左侧有导航,中间是输入框和可自定义参数,右侧有示例和描述。从“示例数据”下载Excel格式的资料,其格式应包括:GO term名称、分类(BP、CC或MF)、转化后的P值或FDR、以及基因数。将数据粘贴到输入框,确保数据...
在GO富集分析中,我们同样使用DAVID工具,将基因集合按照生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞成分(CC)三个维度进行富集分析,并通过柱形图展示结果。这样,科研新手也能轻松地获得发表级的GO富集分析图。为满足更多展示需求,本篇内容还介绍了零代码GO富集分析,将BP、MF、CC和KEGG富集结果整合在一张...
实现R语言GO分析bp mf cc三合一双侧条形图 摘要 在本文中,我将指导一名刚入行的小白如何使用R语言实现GO分析中的bp(生物过程)、mf(分子功能)和cc(细胞组件)三合一双侧条形图。我将逐步介绍整个流程并提供相应的代码示例,帮助小白顺利完成任务。 流程图 ...