输入安装命令: 在终端中,输入以下命令来安装Bowtie2: bash conda install -c bioconda bowtie2 这里,-c bioconda指定了从Bioconda频道安装Bowtie2,因为Bioconda是一个专注于生物信息学软件的Conda频道。 执行命令并等待安装完成: 按下回车键执行上述命令。Conda将会解析依赖关系并下载、安装Bowtie2及其所需的依赖...
但是依然会报错。因为出现undefined symbol的根本原因是,tbb有bioconda, main, conda-forge三个版本,conda-forge是最新的结果,而我安装bowtie2用的就是最新的conda-forge, 而非bowtie2构建时候用的bioconda版本。如果我系统没有自带tbb,那么报错就是 symbol not found, 而非undefined symbol。因此真正的解决方法是卸载...
可以试试:conda install -c bioconda bowtie2
conda安装更好,但这种方法也要学会,因为并不是所有软件都可以conda安装,如果要看conda下安装NGS软件,请看我以前的这篇:用conda安装RNA-seq所需要的工具 养成习惯,安装在固定目录下 比如家目录下,建biosoft文件夹,下面建各个软件的文件夹 $ mkdir biosoft $ cd biosoft/ ~/biosoft$ mkdir bowtie2 ~/biosoft$ cd...