Bowtie2 是一款主要由Ben Langmead(现:约翰霍普金斯大学担任副教授)开发的主要用于对DNA序列进行高效比对的开源软件,其在生物信息学中应用广泛,特别是针对从NGS获得的较长序列。其具有以下特性: 1.高效的序列对比: Bowtie2使用Burrows-Wheeler Transform (BWT) 算法对参考序列建立索引,这使得它能再有限的内存中快速...
Bowtie2是一款高效的DNA序列比对工具，由Ben Langmead开发，适用于生物信息学领域，特别是针对NGS（下一代测序）数据。其主要特点包括：1. 高效序列对比：使用Burrows-Wheeler Transform (BWT) 算法建立索引，可在有限内存下快速处理序列比对。2. 支持长序列与间隔比对：与前版本相比，更擅长处理较长序列...