该程序将核酸/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对,从而找到相似序列。 有在线和单机版两种 需要批量处理、对数据库有特殊要求。涉及序列隐私等情况可以下载使用单机版。 一、BLAST界面 网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ 二、Blastp检索 1.基本检索 1.1 enter query sequence(输入查询序列) query subr...
BLASTP(Basic Local Alignment Search Tool,简称BLAST)是一种在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。它可以迅速与公开数据库进行相似性序列比较,结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLASTP的使用方法如下: 1.输入需要检测的蛋白质序列,可以使用单字母简写。 2.输入两个数值,以确定检测范围...
blastp是BLAST工具集中的一个,专门用于蛋白质序列的比对和搜索,由NCBI开发,基于局部比对算法,可在蛋白质数据库中进行序列相似性搜索。 BLASTP:蛋白质序列比对与搜索的强大工具 BLASTP的定义与背景 BLASTP是BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)工具集中的一员,专注于蛋白质序列的比对和搜索...
BLASTP检索步骤1.1 输入查询序列，可自定义序列范围，默认全部。1.2 选择搜索数据库，一般选择nr/nt，可根据需要选择特定物种。1.3 筛选程序选择，如期望值、单词长度等参数进行设定。2. 算法参数： - 基本参数如最大显示条目、短查询序列影响期望值和范围长度。 - 得分参数包括矩阵选择（如BLO...
Blast套件的Blastn、Blastp、Blastx、Tblastn和Tblastx子工具的用途：1. Blastn：Blastn主要用于核酸序列的比对。它可以对比DNA或RNA序列，查找相似性或相关性。在基因组装、基因表达分析以及基因组注释等研究中，Blastn是首选工具。它能够迅速找到与查询序列相似的已知序列，为后续的生物信息学分析提供基础...
NCBI Blastp：深入解析蛋白质序列比对的强大工具 NCBI Blastp，全称为Protein Basic Local Alignment Search Tool Protein，是你在生物信息学领域中不可或缺的伙伴。它是一种功能强大的工具，专门用于将你的目标氨基酸序列与庞大的蛋白质数据库进行精确的比较，让你能够深入了解序列间的相似性和可能的功能...
BLAST的全称是Basic Local Alignment Search Tool，直译为基本局部序列匹配搜索工具。简而言之，BLASTP是BLAST算法的一种特定实现，针对蛋白质序列进行。它是通过比较一个或多个蛋白质序列与一个数据库中的其他序列，来寻找可能的同源或相似性，以帮助研究者理解蛋白质的功能、结构和进化关系。BLASTP工作原理...
BLASTn和BLASTp是BLAST程序中的两种搜索模式。BLASTn用于比较核苷酸数据库,而BLASTp用于比较蛋白质数据库。两者在搜索算法、比对方式和结果解释上有所不同。
BLAST套件包含了五个强大的子工具：blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx，每个工具都有其特定的用途。首先，blastn用于将指定的核酸序列与数据库中的核酸序列进行比对，以寻找相似性或潜在的遗传关系。blastp则专注于蛋白质序列的比较，它能够在蛋白质数据库中寻找远缘物种间的相似性，有助于理解蛋白...
BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途分别如下：1、blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较。2、blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较，可以寻找较远的关系。3、blastx则是将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中...