生信分析blastp..我用tbtools做blastp的时候,有e-value和得分,这俩分别取多少比较合适哇大佬们,我很纠结,找不到中文有特别注明这俩的,不筛选的话我一个亚家族就有500多个,筛选的话(e-value小于
该程序将核酸/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对,从而找到相似序列。 有在线和单机版两种 需要批量处理、对数据库有特殊要求。涉及序列隐私等情况可以下载使用单机版。 一、BLAST界面 网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ 二、Blastp检索 1.基本检索 1.1 enter query sequence(输入查询序列) query subr...
1.搜索网址：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/进入页面 使用方法 点击proteinblast 使用方法 在此处输入需要检测的蛋白质序列，注意使用单字母简写 使用方法 输入两个数值，以确定检测范围，若全部比对则不需输入 使用方法 输入此次检测的标题名称 使用方法 一些基本设定 比对结果 点击BLAST，开始工作 调整参数，重新...
1. Blastn：Blastn主要用于核酸序列的比对。它可以对比DNA或RNA序列，查找相似性或相关性。在基因组装、基因表达分析以及基因组注释等研究中，Blastn是首选工具。它能够迅速找到与查询序列相似的已知序列，为后续的生物信息学分析提供基础数据。2. Blastp：Blastp是用于蛋白质序列比对的工具。当研究人员需要...
我以前写过说明书:NCBI的blast++软件使用说明书 当然,如果你没有朋友帮你下载,你还是得自己来。...,blastx,tblastn,运行的方法都是一样的 blastp -query seq.fasta -out seq.blast -db dbname -outfmt 6 -evalue 1e-5 -...它在以下几个情况下有局限性: 1)当目标序列过...
allu永远滴神!Astralis vs ENCE - BLAST Premier春季赛 #CSGO# #游戏视频# http://t.cn/A62QHOPg
BLASTP检索步骤1.1 输入查询序列，可自定义序列范围，默认全部。1.2 选择搜索数据库，一般选择nr/nt，可根据需要选择特定物种。1.3 筛选程序选择，如期望值、单词长度等参数进行设定。2. 算法参数： - 基本参数如最大显示条目、短查询序列影响期望值和范围长度。 - 得分参数包括矩阵选择（如...
我做的是本地blast，如果用-m 8输出，其中一列结果是length 指的是aligned长度，我发现其计算的方式是...
BLAST套件包含了五个强大的子工具：blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx，每个工具都有其特定的用途。首先，blastn用于将指定的核酸序列与数据库中的核酸序列进行比对，以寻找相似性或潜在的遗传关系。blastp则专注于蛋白质序列的比较，它能够在蛋白质数据库中寻找远缘物种间的相似性，有助于理解蛋白...
假如两条序列长度不同，相似度不是很高，那么正反比对有的结果应该是相同的，比如identity；有些结果肯定...