(1) 本地安装Linux版BLAST程序 # 创建环境 conda create -n blast # 激活环境 conda activate blast # 搜索可用的BLAST版本 conda search blast # 安装BLAST conda install blast # 查看安装 blastn -h (2) 建立核酸数据库 访问NCBI BLAST数据库官网(ftp.ncbi.nlm.nih.gov/bl),病毒数据库文件在2024年7月...
51CTO博客已为您找到关于linux本地blast的相关内容,包含IT学习相关文档代码介绍、相关教程视频课程,以及linux本地blast问答内容。更多linux本地blast相关解答可以来51CTO博客参与分享和学习,帮助广大IT技术人实现成长和进步。
选择你要安装的地址然后点击install安装 完成安装后点击close关闭 至此安装结束,接下来查看是否安装成攻。 键盘上按住win+R键输入cmd打开命令行,输入下述指令打印blastp文档 blastp -h 出现下面情况表示blast安装成功。 2.2 linux安装blast Linux演示的版本是Ubuntu18.04 在之前的下载页面(如下)下载对应linux版本的blast ...
$ conda install blast 比较简单 1.2 直接下载安装 首先在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载最新版本的BLAST程序。 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.8.1+-x64-linux.tar.g...
51CTO博客已为您找到关于新版blast linux的相关内容,包含IT学习相关文档代码介绍、相关教程视频课程,以及新版blast linux问答内容。更多新版blast linux相关解答可以来51CTO博客参与分享和学习,帮助广大IT技术人实现成长和进步。
首先,确保你的Linux系统中已经安装了BLAST程序。你可以通过以下命令来安装BLAST(以Ubuntu为例): bash sudo apt-get install ncbi-blast+ 同时,你需要准备待比对的序列文件,这些文件通常以.fa或.fasta为后缀。 2. 编写一个Shell脚本 接下来,编写一个Shell脚本来循环调用BLAST程序。假设你的待比对序列文件都存放在...
以下是在Linux系统上安装BLAST的详细步骤: 方法一:使用包管理器安装(适用于Debian/Ubuntu系统) 代码语言:txt 复制 sudo apt update sudo apt install ncbi-blast+ 方法二:从源码编译安装 下载BLAST源码 下载BLAST源码 安装依赖 安装依赖 编译并安装 编译并安装 ...
本文将一步一步地介绍Linux中如何使用BLAST。 第一步:安装BLAST 在Linux系统中,BLAST有如下几个版本可供选择:BLAST+和NCBI BLAST。BLAST+是由NCBI提供的较新版本,拥有更多的功能和改进的性能。NCBI BLAST是由NCBI提供的经典版本。在本文中,我们将介绍如何安装BLAST+。 1.打开终端并使用sudo su命令切换到超级用户...
blastnlinux命令是一种在Linux系统中执行BLASTn程序的命令。BLASTn是一种常用的生物信息学工具,用于在生物序列数据库中搜索相似序列。下面是blastnlinux命令的用法和一些常见参数的解释: 1. 安装BLASTn程序:在Linux系统中安装BLASTn程序可以通过包管理器进行安装,例如使用apt-get命令:sudo apt-get install ncbi-blast...
在Linux中,BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一款常用的序列比对工具。它能够对输入的DNA、RNA或蛋白质序列与数据库中的序列进行比对,从而找到相似性较高的序列。 BLAST命令的基本语法如下: blastn -query [输入文件] -db [数据库文件] -out [输出文件] ...