Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda blast # blast安装perl模块的方法 conda install perl-digest-md5 BLAST的主要理念 Search may take place in nucleotide and/or protein space or translated spaces ...
(2)设置BLASTDB环境变量。 (3)简单使用,使用人TP53基因与人基因组进行比对来演示本地化的BLAST如何使用。 所有安装文件 一、安装 1.1 傻瓜版安装 傻瓜版的安装特别简单,只需要下一步下一步即可,这里不赘述。 1.2 绿色版安装 所谓绿色版,其实就是可执行文件及其各种依赖文件,特点就是解压即可使用。但是为了方便使...
1、进入网站,根据电脑系统选择相应最新版本下载,也可以选择需要的历史版本下载。 2、解压,双击exe文件安装软件,默认安装到C盘,可以自定义安装目录。如果是免安装版本,直接将解压后的文件夹移动到安装目录下。 3、在安装目录下新建文件夹并重命名为db,作为数据库文件夹。 4、右键打开我的电脑-属性-高级系统设置-环境...
在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载 ncbi-blast-2.2.25+-x64-linux.tar.gz 2 解压 如解压到用户的主目录(/home/***)下,把解压后的文件夹重新命名为blast,则BLAST+的所有程序在目录/home/***/blast/bin下。 3 添加环境变量 打开终端(Terminal),切换为root用户,执行vim...
blast 本地安装和使用教程 基本局部比对搜索工具 (BLAST) 可查找两个序列之间具有局部相似性的区域。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算匹配的统计显着性。BLAST 可用于推断序列之间的功能和进化关系,以及帮助识别基因家族的成员。 下载与安装...
1.1 傻瓜版安装：傻瓜版的安装非常简单，用户只需按照安装向导进行操作即可。1.2 绿色版安装：绿色版的安装需要用户解压下载的压缩包，并将解压出的文件夹移动到预设的安装目录。解压包路径为ncbi-blast-2.14.0+-x64-win64.tar.gz，安装目录假定为C:\Program Files。解压并移动后，需要手动添加安装...
本地Blast-图文教程 一、本地Blast用途介绍 二、本地Blast的安装 1、程序安装 2、安装流程 3、用户环境变量设置 三、Blast本地数据库的构建 1、数据的获取 2、数据库的格式化 四、Blast的使用方法 1、query序列的准备 2、查询命令的准备 3、比对结果说明 ...
一、软件下载以及安装 1.进入NCBI官网 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.点击All Resources 3.Downloads 4.BLAST(Stand-alone) ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 5.根据电脑系统下载相应的安装包(*.exe) 6.双击安装,默认即可 ...
一、下载windows 本地BLAST具体操作流程 进入NCBI官网首页点击右边的BLAST 点击Download BLAST 点击这个网址 点击下载适合本电脑的版本 下载地址:ncbi-blast-2.11.0+-win64.exe 我一直使用的是迅雷下载,方便一点,下载到自己常下载软件的路径下面,建议尽量别下载在C盘 ...
1. 最新版本blast ++软件下载及安装过程: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 安装命令行如下: cd ncbi-blast-2.13.0+/bin pwd #复制路径 sudo vi ~/.bash_profile export PATH=$PATH:你复制的路径 source ~/.bash_profile ...