将解压出来的文件夹ncbi-blast-2.14.0+复制到安装目录C:\Program Files。 (3)修改PATH环境变量 我们的安装目录是C:\Program Files\ncbi-blast-2.14.0+,可执行文件都在其下面的bin子文件夹内,为了使我们在运行BLAST时程序能够正确找到可执行文件,我们就需要把C:\Program Files\ncbi-blast-2.14.0+\bin添加到PATH...
psiblast -db /home/thz/F/Database/blast/nr/mynr -query /home/thz/tmp.fasta -out_ascii_pssm tmp.pssm -num_iterations 3 BLAST工具 不同工具的应用范围虽然不同,但是基本参数都是一致的,学会blastp,基本上其他诸如blastn,blastx也都会了。 blastp -db /home/thz/F/Database/blast/nr/mynr -query...
2、运行cmd,转到安装目录下,输入如下命令。 blastx.exe -query xxx.fasta -db db\abc -evalue 1e-5 -out xxx.xml -outfmt"6"-num_alignments 10 -num_threads 2 blastx.exe 程序名,根据需要选择: blastn:输入核酸序列与核酸库比对 blastx:输入核酸序列与蛋白库比对 blastp:输入蛋白序列与蛋白库比对 tbl...
2 解压 如解压到用户的主目录(/home/***)下,把解压后的文件夹重新命名为blast,则BLAST+的所有程序在目录/home/***/blast/bin下。 3 添加环境变量 打开终端(Terminal),切换为root用户,执行vim /etc/profile 在最末尾添加export PATH=”/home/***/blast/bin:$PATH”,保存退出。 或直接找到/etc/profile这个...
下载地址:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 这里我下载的是 Linux 系统的下的 blast 版本. 下面的使用教程也是在 Linux 系统上 解压之后放在你想安装的目录下,就可以了,可执行文件是在bin目录下 快速使用 构建数据库
1.1 傻瓜版安装：傻瓜版的安装非常简单，用户只需按照安装向导进行操作即可。1.2 绿色版安装：绿色版的安装需要用户解压下载的压缩包，并将解压出的文件夹移动到预设的安装目录。解压包路径为ncbi-blast-2.14.0+-x64-win64.tar.gz，安装目录假定为C:\Program Files。解压并移动后，需要手动添加安装...
本地Blast-图文教程 一、本地Blast用途介绍 二、本地Blast的安装 1、程序安装 2、安装流程 3、用户环境变量设置 三、Blast本地数据库的构建 1、数据的获取 2、数据库的格式化 四、Blast的使用方法 1、query序列的准备 2、查询命令的准备 3、比对结果说明 ...
一、下载windows 本地BLAST具体操作流程 进入NCBI官网首页点击右边的BLAST 点击Download BLAST 点击这个网址 点击下载适合本电脑的版本 下载地址:ncbi-blast-2.11.0+-win64.exe 我一直使用的是迅雷下载,方便一点,下载到自己常下载软件的路径下面,建议尽量别下载在C盘 ...
一、软件下载以及安装 1.进入NCBI官网 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.点击All Resources 3.Downloads 4.BLAST(Stand-alone) ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 5.根据电脑系统下载相应的安装包(*.exe) 6.双击安装,默认即可 ...
一、软件下载以及安装 1.进入NCBI官网 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.点击All Resources 3.Downloads 4.BLAST(Stand-alone) ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 5.根据电脑系统下载相应的安装包(*.exe) 6.双击安装,默认即可 ...