点击window的"开始"菜单,在运行中输入cmd,调出MS-DOS命令行,输入命令cdC:\Blast\bin转到BLAST安装目录...
11.按windows+R,在弹出的框中输入cmd, 输入 blastn –help 命令,发现能运行,说明安装成功。
##1.安装配置BLAST+ 首先是下载进程,wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz 对文档解压tar -zxvf ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz 为了方便管理,更喜欢将其移至我的本地安装目录中mv ncbi-blast-2.2.30+ ~/local/app/ # 移...
1. 简介 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool),是一套在DNA数据库或蛋白质数据库中进行局部相似性比对分析的工具,其中包括blastn(核酸比核酸),blastp(蛋白比蛋白)和blastx(核酸比蛋白)、tblastn(蛋白比核酸)等工具。 2. 安装 2.1 利用conda安装 conda install blast 2.2官网下载安装包,解压缩后安装 下载:f...
安装本地BLAST包括下载、解压、设置环境变量和查看版本。使用需先格式化数据库,再进行序列比对,参数多样,如-evalue、-num_threads、-perc_identity等。网络版使用则通过网页选择程序、输入序列和搜索数据库。比对结果包括任务描述、高分匹配片段、E值排序、彩色相似度图和比对详细信息。BLAST提供高效、灵活的...
1.BLAST+的下载与安装 BLAST+下载地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 针对不同的平台(linux,mac,windows)选择性的进行安装,如图一。 下面以mac为例进行介绍: 1.下载:ncbi-blast-2.9.0+-x64-macosx.tar.gz 2.下载完成后,进行解压缩。
blast 比对得分比对位点数相似性分数python代码 blast怎么比对,一、在NCBI中搜索BLAST点击这个,然后来到这个页面,再点来到了这个下载页面,选择合适的,开始下载二、开始安装建议不要安装在C盘。安装结束后,然后设置环境变量,在path后,添加一句:D:\blast-2.12.0+\bin
序列比对怎么做?以下四步要记牢 1、Blast安装(仅首次使用,需要) 2、Blast测试(仅首次使用,需要) 3、Blast建库 4、Blast比对 准备好了吗?Let'go~ 第一步:Blast安装 Windows版本的Blast安装,参照前贴 《什么?我可以用windows电脑玩Blast?》 Linux服务器版本的Blast安装,可使用 Conda方法或者下载源码 ...
1. 安装配置BLAST+程序 在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中下载最新的BLAST可执行程序(不要下载源代码`,源码编译非常慢),选择预编译版本,如ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz。如果服务器能联网,可直接用wget下载。或者,下载后用SFTP客户端传输到服务器上。
一 数据准备与本地Blast安装 在开始本软件的使用教程前,需要按照Blast程序要求的格式将查询文件和数据库文件准备好。而本地Blast的安装可以直接从https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载,并安装到指定目录。或者,读者可以将安装路径添加到系统路径,这样本软件在调用该程序的时候就无需指...