安装httr BiocManager::install("httr",force=TRUE) library(httr)安装pingr BiocManager::install("ping...
然后你就可以愉快地使用install.packages来安装 Bioconductor 包了。 安装体积比较大的 R 包 安装CRAN 或者 Bioconductor 中一些体积比较大的 R 包,如果网络不太好,经常可能会出现包下载不完(Timeout of 60 seconds was reached),从而导致无法正常安装。 参考How do i set a timeout for utils::download.file()...
如果大家现在使用的R语言是 4.3 ,Bioconductor 版本是 3.18 ,那么使用 BiocManager::install 的时候可能会报错 Warning: unable to access index for repository *** ,cannot open URL *** 我们查看一下 :https://new.bioconductor.org/about/mirrors/官方网站,发现bioconductor有新的镜像选择啦,如下所示的设置: o...
为节约镜像站磁盘空间,清华源等也相应移除了这些文件。如果大家现在使用的R语言是 4.3 ,Bioconductor 版本是 3.18 ,那么使用 BiocManager::install 的时候可能会报错 Warning: unable to access index for repository *** ,cannot open URL *** 我们查看一下 :https://new.bioconductor.org/about/mirrors/官方网站...
getOption('timeout')options(timeout=10000) 就算是这样,大家也不可能说去等待三五年去安装一个r包,所以就需要镜像帮助你。假如你使用了传统的镜像地址,就是我们一直推荐的清华大学的镜像: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制 rm(list=ls())options()$reposoptions()$BioC_mirror#options(BioC_mirror="ht...
IX et cetera discusses country code top-level domains (e.g., countryPackage() and packageCountry()), the use of memoization and the internet connection time out problem.getting startedTo install ‘packageRank’ from CRAN:install.packages("packageRank")To...
bioc-issue-botaddedWARNINGSand removedTIMEOUTlabelsDec 10, 2020 Contributor mtmorgancommentedDec 17, 2020 17 December, 2020 DESCRIPTION Good! NEWS hmm, if this is not maintained, then better not to include the file vignettes please addeval = FALSEto the code chunks involving package installation....
options(timeout=10000) 就算是这样,大家也不可能说去等待三五年去安装一个r包,所以就需要镜像帮助你。假如你使用了传统的镜像地址,就是我们一直推荐的清华大学的镜像: rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirror #options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") ...
options(timeout=10000) 就算是这样,大家也不可能说去等待三五年去安装一个r包,所以就需要镜像帮助你。假如你使用了传统的镜像地址,就是我们一直推荐的清华大学的镜像: rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirror #options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") ...
安装CRAN 包 install.packages("annotate") 安装Bioconductor 包 if ( !requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE) ) { install.packages("BiocManager") } BiocManager::install("annotate") 安装github 包 install.packages("devtools") devtools::install_github("kassambara/factoextra")编辑...