sh my_conda_mirror.sh 下一步是配置channels, 比如说我运行脚本的位置是/home6/xzg, 那么添加频道的方法就是下面这种。 conda config --add channels file:///home6/xzg/local_mirror/conda-forge/ conda config --add channels file:///home6/xzg/local_mirror/bioconda/ conda config --add channels ...
conda config --add channels defaults conda config --add channels r conda config --add channels bioconda 3.添加国内镜像源 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda config --setshow_channel_urlsyes conda config ...
Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。 昨天,偶然发现: 8月22号,让生信小伙伴日顾夜盼的bioconda中国镜像已经在清华tuna镜像源的一个服务器上建成了,感谢清华源和那个去呐喊的小伙伴@hyacz。 镜像地址:https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/c...
②其中,channel就是我们经常说道的镜像,那么bioconda其实就是代表镜像的含义。即:Bioconda是conda软件包管理器的一个镜像,专门从事生物信息学软件; ③conda可以给我们提供一个独立的环境,相当于python的virtualenv 通过推文,我了解到如果你正在学习或者使用Python,那么强烈建议你使用miniconda/anaconda而不是系统自带Python/pi...
第二篇,我在某天突然领悟到,原来bioconda解决我们安装软件依赖的途径就是自己准备好软件所需要的依赖包。因此提高下载速度的方法就有了,就是用已有的conda国内镜像源解决依赖包安装问题。 对于一些本身文件就不大的软件,比如说不到10M的压缩包呀,那么不到100kb的下载速度也是等得起的。但是如果遇到200M那么大文件该...
使用方法二: conda config --add channels http://mirror.genek.tv/conda/bioconda/ conda config --add channels http://mirror.genek.tv/conda/conda-forge/ conda config --add channels http://mirror.genek.tv/conda/r/ 镜像每月更新一次 编辑于 2018-09-19 19:38 内容所属专栏 生信笔记 订阅专栏 ...
2. 设置conda的channels conda config --add channels r conda config --add channels defaults # conda环境默认仅装了这一个channel conda config --add channels conda-forge conda config --add channels bioconda 目前清华大学提供了一个conda的镜像,添加后可以非常快速的下载软件,具体添加方法 ...
①首先，看一下conda的安装命令：②其中，channel就是我们经常说道的镜像，那么bioconda其实就是代表镜像的含义。即：Bioconda是conda软件包管理器的一个镜像，专门从事生物信息学软件;③conda可以给我们提供一个独立的环境，相当于python的virtualenv 功能角度：Anaconda＝Miniconda 大小角度：Anaconda > Miniconda...
主要是添加bioconda频道,方便生物软件安装。添加清华的一系列镜像,加速下载,提高成功率。默认仓库不仅速度极慢,而且经常中断,国内镜像下载速度可达国外几百倍。 conda config --add channels defaults conda config --add channels conda-forge conda config --add channels bioconda ...
Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。 昨天,偶然发现: 8 月 22 号,让生信小伙伴日顾夜盼的 bioconda 中国镜像已经在 清华 tuna 镜像源的一个服务器上建成了,感谢那个去呐喊的小伙伴 @hyacz。 镜 像 地 址: https://nanomirrors.tuna.tsinghua.edu....