下面是BIC-seq2的基本使用方法: 1. 准备输入数据:BIC-seq2的输入数据包括比对后的二进制比对文件(BAM文件)、基因组参考序列文件和一组已知的拷贝数变异区域列表(BED格式)。 2. 安装并配置环境:BIC-seq2的运行需要基于R软件,并且需要安装一些依赖库和工具包,如Bioconductor等。你需要根据所使用的操作系统和版本,下...
BIC-Seq2 details: http://compbio.med.harvard.edu/BIC-seq/ BICSEQ2 V1 Ding Lab github project: https://github.com/ding-lab/BICSEQ2 Background reading on creating mappability track: https://wiki.bits.vib.be/index.php/Create_a_mappability_track Note that there seems to be newer version ...
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