bHLH 转录因子 转录因子是RNA聚合酶起始转录需要的辅助因子。它的作用是识别DNA顺式作用位点或识别其他因子或识别RNA聚合酶。bHLH (basic helix-loop-helix)转录因子是真核生物中存在最广泛的一大类转录因子，通过特定的氨基酸残基与靶基因相互作用，进而调节相关基因的表达。碱性区域位于bHLH结构域的N端与HLH基序相邻，由15个
背景:基本螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子参与植物生长发育、次生代谢和非生物胁迫响应,已在各种植物中进行了研究。尽管它们在植物生物学中的重要性,但在玫瑰(Rosa persica)中bHLH家族基因的作用和表达模式尚未确定。方法:本研究利用生物信息学方法系统地分析了R. persica的RbebHLH家族基因,并通过转录组和相关生理指标测量...
ROOTHAIRLESS (RHL)是一种典型的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子(TF),已被报道参与植物生长的各个方面和对胁迫的反应。然而,RHL亚家族成员在毛竹(Phyllostachys edulis)中的功能仍然未知。 在本研究中,我们在毛竹中鉴定了14个bHLH基因(PeRHL1–PeRHL14)。 系统发育树和保守基序分析表明,PeRHL可分为三个分支。 ...
为了进一步揭示生理状态下bHLH转录因子在染色质中识别E-boxes位点的机制,研究人员从果蝇胚胎提取物中重组了染色质,该染色质含有约33500个E-boxes基序,通过ChIP-seq分析转录因子的结合图谱。结果表明bHLH转录因子结合在核小体的近端,(1)其中CLOCK-BMAL1结合到...
72个VnbHLH蛋白均定位于细胞核,推测藜芦bHLH转录因子在细胞核发挥调控功能。 3.3藜芦bHLH转录因子蛋白保守基序分析 对藜芦bHLH转录因子保守氨基酸Motif进行MEME SUITE分析(图2),共获得10个Motif:Motif 1(YIHVRARRGQATDSHSLAERVRREKIS- ERMKYLQELVPGCNK)、Motif 2(TGKASMLD- EI...
3.2藜芦bHLH转录因子家族成员鉴定 通过2次HMMER search搜索,去除差异较大序列(1e-20)共计获得80个注释为bHLH的转录因子,经过CDD和Pfam数据库对其保守结构域进行验证,去除冗余及未获得结构域验证的8条序列,最终获得72个具有典型bHLH结构域的转录因子基因家族成员(表1)。将所得序列依次标号为VnbHLH1～VnbHLH72,最长的...
phasiRNA的产生是必需的，24-PHAS的转录在突变体中有不同的调控过程。综上所述，不同的bHLH家族转录因子在花药发育过程中的不同时间中级联表达，调控绒毡层细胞的分化及减数分裂过程中24-nt phasiRNA的产生，从而实现花药的正常发育，产生正常的育性。论文链接：https://doi.org/10.1093/plcell/koac007 ...
为了进一步揭示生理状态下bHLH转录因子在染色质中识别E-boxes位点的机制,研究人员从果蝇胚胎提取物中重组了染色质,该染色质含有约33500个E-boxes基序,通过ChIP-seq分析转录因子的结合图谱。结果表明bHLH转录因子结合在核小体的近端,(1)其中CLOCK-BMAL1结合到核小体进出位点或附近的E-boxes基序,这些基序紧邻组蛋白八聚...
转录因子bhlh130在番茄抗晚疫病中的功能研究 实验选取番茄晚疫病抗性材料Moneymaker和感病品种Rutgers作为研究对象。通过转录组测序发现，病原菌侵染后抗病品种中bhlh130基因表达量显著上调，在感病品种中未见明显变化。qRT-PCR验证显示，接种病原菌48小时后抗病品种叶片中bhlh130表达量达到对照组的8.7倍，而感病品种仅...
非典型bHLH（又称HLH）转录因子（atypical bHLH transcription factor）因其蛋白缺乏basic序列而不能直接结合DNA，但保留的HLH基序仍具有蛋白二聚化能力，因此是一类重要的转录调控蛋白。非典型bHLH转录因子参与油菜素甾醇信号过程，依照其生理功能的不同，又进一步分为正调控HLH（如AtPRE）和负调控HLH（如AtIBH1）两种...