近年来,全基因组测序技术得到很大的改进与发展,陆续鉴定出许多物种中的bHLH转录因子,丰富了该转录因子家族的体系构建。 bHLH转录因子已被证实在植物生长发育和抵抗非生物胁迫过程中不可或缺。一方面,bHLH转录因子在植物形态发育过程中发挥作用,...
背景:基本螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子参与植物生长发育、次生代谢和非生物胁迫响应,已在各种植物中进行了研究。尽管它们在植物生物学中的重要性,但在玫瑰(Rosa persica)中bHLH家族基因的作用和表达模式尚未确定。方法:本研究利用生物信息学方法系统地分析了R. persica的RbebHLH家族基因,并通过转录组和相关生理指标测量...
对藜芦bHLH转录因子保守氨基酸Motif进行MEME SUITE分析(图2),共获得10个Motif:Motif 1(YIHVRARRGQATDSHSLAERVRREKIS- ERMKYLQELVPGCNK)、Motif 2(TGKASMLD- EIINYVQSLQRQVEFLSMKLA)及Motif 3(LNHVEAERQRREKLNQRFYALRAVVPNISKM- DKASLLGDAISYIKELQRKIKELESE)等。结果(图...
bHLH 转录因子 转录因子是RNA聚合酶起始转录需要的辅助因子。它的作用是识别DNA顺式作用位点或识别其他因子或识别RNA聚合酶。bHLH (basic helix-loop-helix)转录因子是真核生物中存在最广泛的一大类转录因子，通过特定的氨基酸残基与靶基因相互作用，进而调节相关基因的表达。碱性区域位于bHLH结构域的N端与HLH基序相邻...
FIT是调控拟南芥铁稳态的一个关键调控因子,它在转录水平上受到缺铁诱导,但其背后的调控机制还不甚清楚。该研究以拟南芥bHLH38和FIT的单、双过表达植物及bHLH Ib四突变体植物为材料,采用缺铁(-Fe)处理实验和定量RT-PCR的方法从RNA角度分析了FIT转录水平的变化。结果表明:(1)在铁充足时,bHLH38过表达植物中FIT的转录...
ROOTHAIRLESS (RHL)是一种典型的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子(TF),已被报道参与植物生长的各个方面和对胁迫的反应。然而,RHL亚家族成员在毛竹(Phyllostachys edulis)中的功能仍然未知。 在本研究中,我们在毛竹中鉴定了14个bHLH基因(PeRHL1–PeRHL14)。
为了进一步揭示生理状态下bHLH转录因子在染色质中识别E-boxes位点的机制,研究人员从果蝇胚胎提取物中重组了染色质,该染色质含有约33500个E-boxes基序,通过ChIP-seq分析转录因子的结合图谱。结果表明bHLH转录因子结合在核小体的近端,(1)其中CLOCK-BMAL1结合到核小体进出位点或附近的E-boxes基序,这些基序紧邻组蛋白八聚...
phasiRNA的产生是必需的，24-PHAS的转录在突变体中有不同的调控过程。综上所述，不同的bHLH家族转录因子在花药发育过程中的不同时间中级联表达，调控绒毡层细胞的分化及减数分裂过程中24-nt phasiRNA的产生，从而实现花药的正常发育，产生正常的育性。论文链接：https://doi.org/10.1093/plcell/koac007 ...
非典型bHLH（又称HLH）转录因子（atypical bHLH transcription factor）因其蛋白缺乏basic序列而不能直接结合DNA，但保留的HLH基序仍具有蛋白二聚化能力，因此是一类重要的转录调控蛋白。非典型bHLH转录因子参与油菜素甾醇信号过程，依照其生理功能的不同，又进一步分为正调控HLH（如AtPRE）和负调控HLH（如AtIBH1）两种...
拟南芥在铁缺乏条件下，FIT基因的转录水平明显上调。FIT的启动子区域含有多个IDE，这些IDE能够与缺铁响应转录因子bHLH38/39结合，形成复合物，进而调控FIT的转录。除此之外，铜、锌等微量元素的浓度变化也能够影响FIT基因的转录水平。这些微量元素通过RRE调控FIT的转录，进一步调节铁吸收和分配。FIT基因的转录不仅受到其他...