(A) 10X Chromium(上图)和BD Rhapsody(下图)恢复的每种细胞类型中捕获的转录本数量(总计数)。(B) 10X Chromium和BD Rhapsody生成的数据中来自3个不同患者的良性前列腺和PCa组织中的相对细胞类型组成。(C) 10X Chromium与BD Rhapsody生成的数据中来自3个不同患者的良性前列腺和前列腺癌(PCa)组织中检测到的细胞...
最近在群里看到了一个2024的测评文章:《Comparative analysis of 10X Chromium vs. BD Rhapsody whole transcriptome single-cell sequencing technologies in complex human tissues》,基本上的结论是10X单细胞转录组全方位吊打BD平台。 线粒体含量问题 首先是BD平台的线粒体含量过高: 单细胞转录组测序中,如果观察到每...
最近在群里看到了一个2024的测评文章:《Comparative analysis of 10X Chromium vs. BD Rhapsody whole transcriptome single-cell sequencing technologies in complex human tissues》,基本上的结论是10X单细胞转录组全方位吊打BD平台。 线粒体含量问题 首先是BD平台的线粒体含量过高: image-20240705214208307 单细胞...
BD Rhapsody测定实现了与竞品WTA测定类似的聚类性能,而测序读数降低了近10倍(靶向读数2k vs. WTA读数20k)。与使用WTA方法不同,靶向组合(panel)避免了对多个高表达基因的测序如核糖体蛋白或低表达变异性,从而提高测定效率。
且随着技术的发展,样本通量也大幅增加,如BD Rhapsody多样本标签(混样试剂),在单细胞样本制备阶段被引入,使得单次实验单个通道就可以同时做2-12个样本,每个样本的实验成本大大下降,并增加了单细胞测序实验设计的适应性和可塑性。 单细胞测序...
就单细胞测序领域,目前两大商业化的单细胞技术平台(10X Genomics和BD Rhapsody)已受到国内科学家的广泛认可,但涉及的高精尖技术依旧是由外企掌控,本土化服务公司并没有非常大的自主权,很多方面受限于技术垄断,最能直接体现的一点可能就...
就单细胞测序领域,目前两大商业化的单细胞技术平台(10X Genomics和BD Rhapsody)已受到国内科学家的广泛认可,但涉及的高精尖技术依旧是由外企掌控,本土化服务公司并没有非常大的自主权,很多方面受限于技术垄断,最能直接体现的一点可能就是价格方面,这也是很多用户对单细胞的第一印象——价格高,成本负担重。
且随着技术的发展,样本通量也大幅增加,如BD Rhapsody多样本标签(混样试剂),在单细胞样本制备阶段被引入,使得单次实验单个通道就可以同时做2-12个样本,每个样本的实验成本大大下降,并增加了单细胞测序实验设计的适应性和可塑性。 单细胞测序技术——后端 与此同时,后端测序平台的拓宽也意味着实验者将拥有更多、更...
BD Rhapsody测定实现了与竞品WTA测定类似的聚类性能,而测序读数降低了近10倍(靶向读数2k vs. WTA读数20k)。与使用WTA方法不同,靶向组合(panel)避免了对多个高表达基因的测序如核糖体蛋白或低表达变异性,从而提高测定效率。 更有效的测序可以更低的成本实现更高的通量...
利用BD Rhapsody系统进行单细胞捕获、cDNA文库构建和测序,测序数据在NovaSeq PE150平台上进行分析。 单细胞数据及下载 GSM5242413_N711_RSEC_MolsPerCell.csv.gz 998.8 Kb GSM5242413_N711_RSEC_ReadsPerCell.csv.gz 1.4 Mb GSM5242414_N712_RSEC_MolsPerCell.csv.gz 5.7 Mb GSM5242414_N712_RSEC_ReadsPerCe...