点击网址(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/)进入BATMAN-TCM数据库主页,全称为Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine,是一款用于中草药分子机制挖掘的在线分析工具,于2016年发布,最近一次维护在2020年3月31号。数据库基于中草药成分的靶基因预测结果,进行GO/KEGG...
BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine)是一个通过中药复方的组成成分分析化合物与作用靶点的关系,并对作用靶点的作用通路和疾病进行相关联系的中药靶点数据库。它不仅可以用来分析现有中药复方成分分子机制,还可以自定义配方组成成分来进行靶基因预测和网络分析。
用户在使用BATMAN-TCM时,首先需输入感兴趣的中药名称或方剂。系统支持直接输入复方名称(拼音)、中草药名称(拼音)或化合物ID。以麻黄汤为例,用户应输入麻黄、桂枝、杏仁与甘草的拼音。接下来,用户需设置两个关键参数:Score cutoff(筛选阈值)与Adjusted P-value(调整P值)。Score cutoff用于筛选候...
BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of Traditional Chinese Medicine)是一个专门设计的在线生物信息学分析工具,致力于研究中药的分子机制。通过BATMAN-TCM,研究者可以分析中药复方的组成成分与化合物、作用靶点之间的关系,同时关联作用靶点与疾病。该数据库不仅支持分析现...
因此,我们研发了首个中药入血成分数据库DCABM-TCM (http://bionet.ncpsb.org.cn/dcabm-tcm/)。该数据库通过手工文献挖掘,首次系统收集中药复方和草药的实验检测到的入血成分以及相应的详细的检测条件;同时支持两种中药入血成为基础的...
多年来临床用于治疗坐骨神经痛、腰椎间盘突出症、风湿性骨关节炎等,效果良好.文献报道舒筋健腰丸能够抑制大鼠骨关节炎模型中血清以及病变处IL-ip、TNF-a、PGE2的升高,数据库分析显示舒筋健腰丸中的延胡索碱等成分能够调控IL-ip、TNF-α、PGE2受体等作用靶点,提示这一数据库分析的部分结果与已有实验结果相符,具有...
3. BATMAN-TCM:http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/ 我们可以直接输⼊中药拼⾳查有关的化合物以及基因,⽐如六味地黄汤的化合物以及基因结 果:输⼊拼⾳后预测到的化合物和基因:对这些基因进⾏的通路、疾病和GO功能注释:建⽴的⽹络关系:BATMAN-TCM是最好⽤的,功能也⽐较齐全。
从基金的角度来说,大家的总体感觉是中医药方向的基金比较好中,每年基金中标的申请人里面也有一些的没有SCI文章的。今天我们换个角度,梳理下中药研究中常用的数据库和网站。 1.TCMGeneDIT:http://tcm.lifescience.ntu.edu.tw/ 收录的信息包括:中药、基因、疾病、成分和疗效:...
因此,BATMAN-TCM团队研发了首个中药入血成分数据库DCABM-TCM (http://bionet.ncpsb.org.cn/dcabm-tcm/)。该数据库通过手工文献挖掘,首次系统收集中药复方和草药的实验检测到的入血成分以及相应的详细的检测条件;同时支持两种中药入血成为基础的数据分析功能:中药分子作用机制揭示和中药为基础的药物发现(图1)。