对于Windows系统,在MSYS界面中输入以下命令进行编译安装: ./configure make make install 编译完成后,终端提示Autodock安装成功。如果出现问题,可以查看错误提示进行修复。二、AutoDock-vina的安装 下载安装包从官网下载AutoDock-vina的安装包。注意选择适合自己操作系统的版本。 解压安装包将下载的安装包解压到本地目录中。
本文安装win版本可能暂不使用其他系统,点击进入Autodock vina官网,下载如下图所圈版本 2.下载完成,双击安装,全部默认即可(记一下安装路径便于下一步找到vina.exe文件) 3.找到vina.exe文件,如下图所示路径一般都是这个根据自己的电脑寻找即可 4.创建对接默认文件夹(便于存放一些蛋白和分子文件)注意该文件夹路径不要...
1b.从网站上下载“vina_1.2.3_windows_x86_64”预编译版程序。 2b.打开cmd或同类型的命令交互界面(e.g. PowerShell, Anaconda...),输入以下命令将“vina_1.2.3_windows_x86_64”重新命名为“vina_1.2.3_windows_x86_64.exe”。 PS: 不能直接在图形界面上重命名,需要通过命令行操作! > mv .\vina_1.2...
下载好Autodock/Autodock vina及MGLTools后,将MGLTools安装包里的mgltools_win32_1.5.7_Setup.exe 文件复制到Autodock/Autodock vina的安装文件夹目录下 双击“autodocksuite-4.2.6.i86Windows.exe”选择好安装路径下载安装即可使用。 python: Download Python | Python.org 直接点击“Download” 直接安装到目标路...
http://vina.scripps.edu/ 也是只有32位的 vina直接安装就可以了 Installing Autodock Vina Double click on the downloaded msi file. Select an appropriate location to install and wait to finish. This will create a new folder named ‘Vina-xxx‘. There you will find vina.exe that will be required...
首先，找到Autodock Vina的下载资源并通过官网下载Windows版本，然后安装并确认其无图形界面的命令行性质。对接前，准备好受体pdbqt文件、配体pdbqt文件和对接位点数据，推荐不使用AutodockTool而是用DS和Open Babel进行文件处理以减少错误。具体步骤包括使用DS软件处理PDBID为4mds的蛋白，确定并保存对接位点，...
在Windows系统上实现分子对接功能，AutoDock Vina的安装是关键步骤。首先，你需要两个主要工具：MGLTools和AutoDock Vina的可视化辅助。MGLTools，作为Vina的可视化支持，对于非编程用户来说，它的存在至关重要。没有它，部分操作可能会变得复杂和艰难。AutoDock Vina则是实际执行分子对接任务的核心程序。它的...
1、autodock vina(简称 vina)是一款免费开源的分子对接软件,由美国斯克利普斯研究所(the scripps research institute)oleg trott 博士开发。vina 在 autodock 4 的基础上做了极大的改进,主要是算法上的改进,促使它在结合模式预测的平均准确率和计算速度方面都远超autodock 4。更多介绍请访问:/。vina 有 windows、lin...
然后安装autodock和autodock tools，就可以了，安装目录最好不要有空格和汉字，就是说不要安装在c盘的...
Windows 系统中安装 Vina 1、双击点击二进制文件 autodock_vina_1_1_2_win32.msi,按提示点击安装即可。2、由于 Vina 没有用户图形界面(GUI),因此,不会在开始菜单栏出现。默认安装在 C:\ProgramFiles\TheScrippsResearchInstitute\Vina,或者C:\ProgramFiles(x86)\TheScrippsResearchInstitute\Vina 下面。 3、为 ...