解压安装包将下载的安装包解压到本地目录中。 安装vina双击解压后的文件夹中的vina.exe文件,按照提示进行安装。注意在安装过程中选择合适的安装路径。 配置环境变量将vina的执行路径添加到系统的环境变量中,这样可以在任何位置运行vina。根据所使用的操作系统,在环境变量中添加vina的执行路径。 测试vina是否安装成功在终...
1b.从网站上下载“vina_1.2.3_windows_x86_64”预编译版程序。 2b.打开cmd或同类型的命令交互界面(e.g. PowerShell, Anaconda...),输入以下命令将“vina_1.2.3_windows_x86_64”重新命名为“vina_1.2.3_windows_x86_64.exe”。 PS: 不能直接在图形界面上重命名,需要通过命令行操作! > mv .\vina_1.2...
2.点击安装,默认安装即可,记住安装路径即可,安装好后找到这个路径文件夹里的adt文件下面圈起来的, 3.把adt复制到和上一步第4步vina.exe在一起的创建的默认文件夹中 4.安装完成!点击adt即可打开AutoDockTools可视化界面,vina在这里也可以用。 安装下vina提升版本(选看) 先简单介绍下所要安装的其他版本,另外如果你...
http://vina.scripps.edu/ 也是只有32位的 vina直接安装就可以了 Installing Autodock Vina Double click on the downloaded msi file. Select an appropriate location to install and wait to finish. This will create a new folder named ‘Vina-xxx‘. There you will find vina.exe that will be required...
Windows 系统中安装 Vina 1、双击点击二进制文件 autodock_vina_1_1_2_win32.msi,按提示点击安装即可。2、由于 Vina 没有用户图形界面(GUI),因此,不会在开始菜单栏出现。默认安装在 C:\ProgramFiles\TheScrippsResearchInstitute\Vina,或者C:\ProgramFiles(x86)\TheScrippsResearchInstitute\Vina 下面。 3、为 ...
使用AutoDockVina执行docking预测。 在windows命令行提示符或linux终端下运行命令 vina--config conf.txt,大概需要几分钟时间。 2. 输出结果包含两个文件,构象文件dockingResult.pdbqt和日志文件docking.log。 dockingResult.pdbqt: 包含所有docking的模式,通常第一个为结合最好的构象,但如果前几个能量值相差不大时也有...
pymol对接mgltoolsvinaautodocknumpy 在Windows下使用autodock.py进行对接HYD@温医1.python,pymol和numpy的安装autodock.py是pymol的插件,要使用autodock.py需要有pymol。安装pymol前需要先安装python,本教程使用python2.5(其他版本可能会导致最终无法顺利使用autodock.py进行对接),包括32位和64位,安装程序见对文件夹...
AutoDL能docker吗autodock安装 用于计算LeDock,AutoDock和AutoDockVina的对接盒子插件背景背景简介 本PyMOL插件是2014年发表于BioMS论坛的 (http://bioms.org/thread-1234-1-1.html)。以下是转过来的原文。目前支持AutoDock、AutoDockVina和LeDock和对接盒子的获取。LeDock是苏黎世大学ZHAO Hongtao博士开发的一款跨平台 ...
conda install openbabel -c conda-forge #安装openbabel # 注意,使用babel时要激活openbabel的conda环境。 openbabel使用手册: 2.3 安装autodock vina apt install autodock-vina 2.4 安装MGLTools 使用wget下载MGLTools安装包 wget -c http://mgltools.scripps.edu/downloads/downloads/tars/releases/REL1.5.6/...
PS：现在的Autodock MGLTools根本不需要安装什么cywin了。关于autodock vina结果的查看，可以见这里http:...