在Y1H筛选中发现与ATG8B和ATG8E启动子相互作用的TFs与通过DAP-seq检测到的TFs之间存在显著的重叠。 图2 Y1H筛选鉴定ATG8B和ATG8E基因表达调控因子 图3 TF-promoter互作图谱 2. TGA9与ATG8启动子结合验证 作者为了证实这些转录因子在植物细胞中的生物学相关性,在拟南芥原生质体中进行了快速验证评估,选择bZIP...
图3 肿瘤内源性 Atg16l1 的缺失改变了肝脏中 CRC 细胞的表型和组成。a UMAP维度中八个scRNA-seq簇的可视化：Prolif（n=5154），Sensory/secretory（SS）（n=1956），成熟肠细胞（ME）（n=2378），神经内分泌（NE）（n=1046），肠细胞祖细胞（EP）（n=2467），IFN响应（n=369），干细胞（n=1320），和粘液...
由于ATG16L1 KO CRC类器官在免疫正常的BL6宿主中未形成肿瘤,因此研究者的分析仅限于NSG宿主中生长的肿瘤的髓系室。在本研究中,研究者对NSG小鼠肝脏内种植的WT和ATG16L1 KO肿瘤分选的髓系细胞进行了scRNA-seq分析,这些髓系细胞分为10个簇(图4a,b)。巨噬细胞亚群包括TREM2+、VSIG4+、MARCO+和ifn反应性巨噬...
同样,如果您严重设计MVC,希望您选择的框架将弥补您的缺口,无论您使用Struts还是ATG,它都不会产生巨大的差异。如果您了解并使用设计原则,您会发现在框架之间可以在框架之间旋转很容易。 最好的代码将遵循摘要的良好设计原则(例如,真实的MVC),并使用所选择的框架中的正确工具实现它(实现它)以便使用它们的方式。 回到...
摘要:本发明提供了自噬基因ATG9在水稻育种和/或水稻粒型机制研究中的应用,属于植物学和生物技术领域。所述的自噬基因ATG9的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;所述的自噬基因ATG9的编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。自噬基因ATG9对提高水稻产量和品质具有非凡的意义,可以作为创造水稻籽粒品质改良的新靶...
g 体外培养Atg16l1敲除与WT类器官的GSEA分析(bulk RNA-seq),对每个scRNA-seq簇标记的前100个基因进行标记。x轴表示簇,y轴显示标准化富集分数(标准化为相同大小的随机样本的平均富集)。h 来自面板(g)的GP簇的GSEA富集图。对于面板(g和h),使用fgsea计算了标准化富集分数,使用voom+limma得出的倍数变化;通过排列...
利用Plant cisstrome数据库，分析了Y1H筛选和DNA亲和纯化测序(DAP-seq)的候选基因之间的重叠。在Y1H筛选中发现与ATG8B和ATG8E启动子相互作用的TFs与通过DAP-seq检测到的TFs之间存在显著的重叠。作者选择bZIP家族成员TGA9作为初步候选进行进一步分析，因为该TF与ATG8B和ATG8E启动子结合，在原生质体中过...
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