相比起来,ATAC-seq是用Tn5转座酶,操作起来也更加简单,重复性好,而且最重要的一点是实验只需要很少的细胞/组织量,出来的信号也更加漂亮,所以ATAC-seq目前已经是研究染色质开放性首选的技术方法。 根据这张图我们比较一下这几个技术,ATAC-seq出来的结果,和传统方法出来的结果具有很强的一致性,ATAC-seq也可以剪掉核小...
snRNA-seq共获得40530个核转录组,平均每个核1335个基因;scATAC-seq共检测到18213个核的开放染色质,平均每个核24333个片段(n=7);空间转录组平均每个样本包含3874.5个spot,每个spot包含1813个基因。进一步对scRNA-Seq进行细胞类型注释共鉴定到10种主要的细胞类型和几个亚群(总共n=24个簇),而scATAC-seq能够鉴定到在...