ATAC seq说到底是检测染色质开放区域的，通过Tn5 切割DNA 然后建库测序达到这个目的，因为Tn5不会切割单...
ATAC seq说到底是检测染色质开放区域的，通过Tn5 切割DNA 然后建库测序达到这个目的，因为Tn5不会切割单联DNA，所以开放染色质的区间不会有reads，所call的reads的peak全部来自不开放的染色质区（转录活性比较低）具体请看两个视频，16 - 细数表观组学(数量、多组学分析课程)1826 播放 · 9 赞同视频 19 ...
寻找能够被转录因子结合的热点区域，也就是在ATAC-seq测序中被较多reads所覆盖的区域。我一开始也是以为...
ATAC seq说到底是检测染色质开放区域的，通过Tn5 切割DNA 然后建库测序达到这个目的，因为Tn5不会切割单联DNA，所以开放染色质的区间不会有reads，所call的reads的peak全部来自不开放的染色质区（转录活性比较低）具体请看两个视频，16 - 细数表观组学(数量、多组学分析课程)1827 播放 · 9 赞同视频 19 ...
具体到ATAC-seq的peak calling，就是找到基因组上开放程度高的区域，这些区域一般开放信号较强，更有可能...
Peak calling不一定是针对ATAC-seq，只要数据形式形如bed或bam等genome track文件。稍微处理一下就可以用...