ATAC-seq文库的构建包括细胞核制备、转位和扩增三个步骤。首先,将待检查的组织或细胞悬置为完整的、均匀的单细胞,随后在裂解缓冲液中培养产生粗核(图3A)。其次,悬浮的细胞核在转位反应混合物中孵育,产生DNA片段(图3B)。最后,将转置的DNA进行扩增,生成测序文库(图3C)。转座酶与样品染色质的反应是ATAC实验的关键步...
ATAC-seq文库的构建包括细胞核制备、转位和扩增三个步骤。首先，将待检查的组织或细胞悬置为完整的、均匀的单细胞，随后在裂解缓冲液中培养产生粗核（图3A）。其次，悬浮的细胞核在转位反应混合物中孵育，产生DNA片段（图3B）。最后，将转置的DNA进行扩增，生成测序文库（图3C）。转座酶与样品染色质的反应是ATAC实验...
tn5酶具有高效的剪切和adaptor引入能力,使得文库构建过程非常迅速,从而加速实验进程。tn5酶在ATAC-seq中被广泛应用。ATAC-seq用于研究染色质的开放状态,以识别基因调控区域、转录因子结合位点等。tn5酶的双功能使其能够快速构建ATAC-seq文库,提供高质量的数据。除了ATAC-seq,tn5酶还用于其他染色质可及性分析技术,如DNase...
Hieff NGS® ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina®是针对Illumina®高通量测序平台研发的用于ATAC-Seq实验的文库构建试剂盒,适用于100-100,000个细胞起始量的样本建库。ATAC-Seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)技术能够利用Tn5 转座酶识别染色质开放区域,快速有效的...
ATAC-seq文库的构建包括细胞核制备、转位和扩增三个步骤。首先,将待检查的组织或细胞悬置为完整的、均匀的单细胞,随后在裂解缓冲液中培养产生粗核(图3A)。其次,悬浮的细胞核在转位反应混合物中孵育,产生DNA片段(图3B)。最后,将转置的DNA进行扩增,生成测序文库(图3C)。转座酶与样品染色质的反应是ATAC实验的关键步...
一般而言,ATAC-seq文库构建的实验流程包括以下几个部分: 1. 细胞核制备 裂解细胞,制取细胞核。常用的基础细胞裂解液,适用于人源、鼠源的细胞系。对于其他细胞系的裂解,可以在基础细胞裂解液中添加相应的成分。 2. 片段化 打断基因组,获取目的片段。此模块需包含一个孵育测序接头的转座酶,近岸蛋白质可提供特殊优化...
一般而言,ATAC-seq文库构建的实验流程包括以下几个部分: 1. 细胞核制备 裂解细胞,制取细胞核。常用的基础细胞裂解液,适用于人源、鼠源的细胞系。对于其他细胞系的裂解,可以在基础细胞裂解液中添加相应的成分。 2. 片段化 打断基因组,获取目的片段。此模块需包含一个孵育测序接头的转座酶,近岸蛋白质可提供特殊优化...
1.一种ATAC-seq测序文库的构建方法,其特征在于,包括如下步骤: S1、细胞裂解提取细胞核; S2、转座反应及纯化; S3、PCR富集及纯化; S4、文库质检及上机。 2.如权利要求1所述ATAC-seq测序文库的构建方法,其特征在于,步骤S1中所述细胞裂解细胞核的提取过程为:对于细胞样本,复苏解冻细胞,进行细胞裂解提取细胞核;对于...
ATAC-seq文库的构建包括细胞核制备、转位和扩增三个步骤。首先,将待检查的组织或细胞悬置为完整的、均匀的单细胞,随后在裂解缓冲液中培养产生粗核(图3A)。其次,悬浮的细胞核在转位反应混合物中孵育,产生DNA片段(图3B)。最后,将转置的DNA进行扩增,生成测序文库(图3C)。转座酶与样品染色质的反应是ATAC实验的关键步...
影子基因使用自主研发的ATAC-seq 建库试剂盒进行ATAC文库构建,实现从组织样本中高效提取细胞核。结果表明:影子基因ATAC-seq 建库试剂盒提核效果佳。 注:细胞核分散,边界清晰且圆滑,无不规则形状,染色深,细胞核状态比较致密则表示提核效果优秀 2.3 性能优异,100个细胞投入量也能获得良好的结果 ...