ATAC-seq的原理是利用Tn5转座酶能够结合开放染色质的特性。具体来说,Tn5酶会捕获DNA序列,并在细胞核内的染色质DNA上进行随机转座。转座成功的DNA会被加上测序用接头序列,然后通过PCR扩增、高通量测序和生物信息学分析,就可以推断出染色质区域的可及性,进一步挖掘转录因子结合区域和核小体的区域啦。您是想了解ATAC-s...
图3. ATAC-seq的原理和工作流程。 A. ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq的原理。B. ATAC-seq数据分析的通用流程。 ATAC-seq技术通常需要额外的步骤来去除线粒体DNA的污染,这可以通过实验和分析来完成;一些高通量测序技术不可避免地会产生错误或偏差,包括ATAC-seq。研究发现Tn5转座酶优先靶向核小体DNA的出入位点,这...
atac-seq原理 ATAC-seq原理: 利用转座酶Tn5可结合开放染色质的性质,使用Tn5酶捕获DNA序列,进而上机测序。 1、DNA与组蛋白结合后形成核小体,核小体再进一步折叠压缩后最终形成染色质。DNA的复制和转录都需要将染色质紧密结构打开,从而允许调控因子结合DNA。这部分被打开的染色质,就叫开放染色质区域(Open Chromation ...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin high throughput sequencing)是一种高通量的分子生物学技术,是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色体上的开放染色质区域即染色质可及性。 原理:利用转座酶Tn5可结合开放染色质的性质,使用Tn5酶捕获DNA序列,进而上机测序。
ATAC-Seq技术的原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性，然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。DNA转座，是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象，由DNA转座酶来实现。这种转座插入DNA，也是需要插入位点的染色质是开放的，否则就会被高级结构给卡住。转座酶可以随机结合并切割染色质开放区...
Atac-seq技术基于转座酶与DNA结合并转座到暴露的染色质区域的原理。转座酶是一种可以特异性地结合到一些DNA序列并切割DNA的酶,常用的转座酶是Tn5转座酶。通过将DNA与转座酶一起处理,可以将转座酶结合到染色质上的暴露区域。 Atac-seq的实验步骤如下: 1.细胞固定和裂解:首先,将待研究的细胞固定在生长条件下,并用...
ATAC-seq,全称Assay forTransposase-AccessibleChromatin with high throughput sequencing,是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用来研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法。 ATAC-seq的原理是啥 要理解这项技术...
ATAC-Seq是“Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput Sequencing”的缩写。ATAC-Seq方法依赖于使用高活性转座酶Tn5的下一代测序(NGS)文库的构建。 将NGS接头连接到转座酶上,该转座酶可以使染色质断裂并同时将这些接头整合到开放的染色质区域中。构建的文库可通过NGS测序,并使用生物信息学分析具...
嘉因生物-ATAC-seq实验原理及应用, 视频播放量 1109、弹幕量 0、点赞数 21、投硬币枚数 11、收藏人数 57、转发人数 23, 视频作者 表观遗传上海嘉因, 作者简介 2014年伊始 专注表观遗传10年 更专业 更放心 http://www.rainbow-genome.com/,相关视频:千年诅咒,2026年即将发
ATAC-seq利用一个被称为Tn5转座酶的蛋白质将测序接头插入到活跃的染色质区域，转座酶的作用导致DNA断裂，产生长度不等的DNA片段。这些片段反映了染色质的开放状态，因为紧密包裹的DNA区域对转座酶不可及。插入测序接头的DNA片段随后通过PCR方法扩增，然后进行高通量测序。测序得到的数据经过分析，可以揭示哪些...