ATAC-Seq实验仅需要约50,000个细胞作为起始样本,并且其相对较短的两步实验,是开始表观遗传过程的一种有吸引力的方法。无论您是要分析样品中染色质的状态还是比较特殊处理前后的染色质状态,ATAC-Seq都可以让您研究全基因组染色质的变化,并可以提供相关指导如应该进行哪些表观遗传修饰或转录因子的研究,以及在后续实验...
ATAC-Seq与ChIP-Seq的不同的是ATAC-Seq是全基因组范围内检测染色质的开放程度,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息,一般用于不知道特定的转录因子,用此方法与其他方法结合筛查感兴趣的特定调控因子;但是ChIP-Seq是明确知道感兴趣的转录因子是什么,根据感兴趣的转录因子设计抗体去做ChIP实验拉DNA,验...
ATAC-Seq是一种高效表观遗传学研究工具,依赖于高活性转座酶Tn5和下一代测序(NGS)技术构建文库。其主要优势在于使用较少细胞(约50,000个)在较短时间内完成实验,且可同时评估开放染色质、核小体定位与转录因子占用。与其他技术相比,它在所需样品数量方面有显著改进,且具备生成高分辨率图谱的能力。...
ATAC-Seq向研究人员提供有关整个基因组中可及染色质的信息,而不涉及具体表观遗传学机制。许多研究人员已开始使用ATAC-Seq作为初步筛查方法来鉴定样品之间可及染色质区域的变化,然后他们可以据此进行后续实验。 本文讨论了ATAC-Seq是什么,它的历史,工作原理以及使用ATAC-Seq发现的一些成果。 什么是ATAC-Seq? ATAC-Seq...