ATAC-seq(转座酶可及性染色质测序)是一种通过高通量测序技术研究基因组中染色质可及性的方法,主要用于揭示调控基因表达的开放染色质区域
ATAC-seq(Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing)是一种快速检测方法,可通过识别具有开放或可及状态的染色质区域来分析整个基因组的表观遗传概况。 ATAC-Seq实验仅需要约50,000个细胞作为起始样本,且实验步骤相对较为简单,是开始表观遗传研究的一种非常高效的方法。 ATAC-Seq 实验...
ATAC-seq可以用来研究免疫细胞在激活或分化过程中的染色质动态变化,这对于理解免疫应答的调控具有重要意义。 (10)时间生物学 通过在不同时间点对细胞进行ATAC-seq分析,研究者可以观察染色质可及性的时间变化模式,这对于理解生物钟和细胞周期调控至关重要。 ATAC-seq的实验原理使其成为一种非常有力的工具,用于研究染色...
ATAC-Seq实验仅需要约50,000个细胞作为起始样本,并且其相对较短的两步实验,是开始表观遗传过程的一种有吸引力的方法。无论您是要分析样品中染色质的状态还是比较特殊处理前后的染色质状态,ATAC-Seq都可以让您研究全基因组染色质的变化,并可以提供相关指导如应该进行哪些表观遗传修饰或转录因子的研究,以及在后续实验...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的...
ATAC-Seq实验原理 ATAC-Seq技术的原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性，然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。DNA转座，是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象，由DNA转座酶来实现。这种转座插入DNA，也是需要插入位点的染色质是开放的，否则就会被高级结构给卡住。转座酶可以随机结合...
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那什么是ATAC-seq技术呢?ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的实验。 真核生物的DNA并不是裸露的, 由组蛋白与之结合。DNA缠绕在组蛋白上,形成串珠式结构。这样的结构进一步折叠,并在其它蛋...
ATAC-seq和CUT&Tag联合分析,可以对ATAC-seq得到的一些转录因子结合区进行验证。从ATAC-seq我们可以了解到染色质的可接近性的动态变化,由于由于染色质的可及性与调控元件或转录因子的结合密切相关,在转录调控中发挥着重要的作用。CUT&Tag整合分析可以进一步探究调控某一生物学过程的关键因子(包括顺式调控元件和转录因子...
Assay for Transposase-Accessible Chromatin(ATAC-seq)是美国 Stanford 大学的 William Greenleaf 教授在 2013 年利用 DNA 转座酶结合高通量测序技术,研究染色体的可及性的方法。ATAC-seq 技术是利用 Tn5 转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,再通过高通量测序获得在该特定时空下基因组中 所有活跃转录的...
单细胞ATAC-seq是研究表观遗传学调控的利器,该技术经常被应用于疾病发生、细胞发育等方面。 Darren A C等人利用单细胞ATAC-seq技术绘制了雄性小鼠13个组织的染色质可及性图谱,发现了85类染色质可及性及约40万个潜在的调节元件,为了解哺乳动物的染色质可及性打下了基础。