从GDC下载ATAC-seq癌症特异性高峰并导入R.之后,进行食管腺癌(ESAD)与食管鳞状细胞癌(ESCC)的分析,并将结果可视化为火山图和热图。 1.3目标和目的 下载并理解ATAC-seq数据 比较两组不同的样本ATAC-seq数据 3 导入R包 # to read txt files library(readr) # to transform data into GenomicRanges library(GenomicR...
##fastq-dump fastq-dump sra/SRR2927015.sra --gzip :输出文件以gz格式压缩 --split-3 :输入文件为双端测序文件 -A :输出文件名 -O :输出目录 $ cat config.sra 2-ceLL-1 SRR2927015 2-ce11-2 SRR2927016 2-ce11-5 SRR3545580 2-ce11-4 SRR2927018 ##循环处理 cat config.sra | while read i...
90s快速了解ATAC-seq 诺禾致源官方账号 1.0万0 scATAC-seq 单细胞染色质可及性数据全流程分析-最佳实践 scverse 73240 03:27 【20220918】【转录组+ATAC-seq联合分析】 一块基因砖 25:57 ATAC-seq 讲解 康测科技 18441 2:24:03 RNA-seq转录组数据分析入门实战 ...