植物ATAC-seq文献集锦(一)——基因组篇 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput Sequencing)是一种用于探究染色质开放性区域的技术,该技术利用Tn5转座酶接近核小体疏松区域切割暴露的DNA,获得开放的染色质区段(Open Chromatin),通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘潜在的活跃转录因子...
目前,单细胞转录组测序(Single-cell RNA sequencing,scRNA-seq) 是一种流行且强大的技术, 可一次性解析成千上万个单细胞的基因表达情况,已经广泛应用于细胞图谱构建、细胞发育轨迹刻画、疾病机理研究。时代的洪流奔涌而至,scATAC-seq与scChIP-seq也逐渐应用起来。小编今天就简要介绍一下ATAC-seq和ChIP-seq的相关原理。
ATAC-seq,全称Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughout sequencing,即转座酶可接近染色质测序,是一种创新的表观遗传学研究技术。ATAC-seq的核心技术酶--转座酶Tn5可以把DNA序列进行随机打断,将测序接头直接插入到开放...
技术介绍 | 详解 ATAC-Seq ATAC-seq,全称 Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing,是 2013 年由斯坦福大学 William J. Greenleaf 和 Howard Y. Chang 实验室开发的用来研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法。 真核生物的核 DNA 并不是裸露的,而是组蛋白与之...
单细胞ATAC测序（Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing，ATAC-seq）作为一把的“分子钥匙”，正逐步揭示细胞内部那深不可测的基因调控网络。LabEx可提供 scRNA-seq/scATAC-seq服务，对同一细胞进行全基因组表观基因组分析和转录组联合分析。一、单细胞ATAC测序是什么？单细胞ATAC测序，我们首先要...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是2013年由美国的Stanford大学William Greenleaf开发的检测开放染色质的方法,主要依赖于Tn5转座酶对片段化DNA和整合入活化的调控区域的高敏感性[6]。 图4. ATAC反应原理图...
为了研究染色质的这种特性,大家都先后尝试了好多测序来检测染色质可及性。但是目前最常用的是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的ATAC-seq(Assay forTransposase-AccessibleChromatin with high throughput sequencing),一种捕获染色质可及性(染色质开放性)的测序方法。
ATAC-seq是“Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput Sequencing”的缩写，最早是由斯坦福大学的Howard Chang和William Greenleaf实验室的首席研究员Jason Buenrostro于2013年在Nature Methods首次发表。3、ATAC-seq的原理及过程 ATAC-seq是一种研究表观遗传的创新型技术，它是一种在全基因组水平上...
单细胞ATAC-seq技术,顾名思义就是在单细胞水平上的ATAC-seq技术,它兼具单细胞技术的高分辨率及ATAC-seq的优势,是目前研究基因表观组学的热门技术。ATAC-seq的全称是Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,是基于高通量测序对开放性染色质(open chromatin)进行研究的技术。
单细胞ATAC测序(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing,ATAC-seq)作为一把的“分子钥匙”,正逐步揭示细胞内部那深不可测的基因调控网络。LabEx可提供 scRNA-seq/scATAC-seq服务,对同一细胞进行全基因组表观基因组分析和转录组联合分析。