ATAC - seq（Assay for Transposase - Accessible Chromatin using sequencing），即转座酶可及染色质测序...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是美国Stanford大学的William Greenleaf教授在2013年所研发的一种全新方法,其主要是利用DNA转座酶结合高通量测序技术,…
ATAC-seq(Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing)是一种快速检测方法,可通过识别具有开放或可及状态的染色质区域来分析整个基因组的表观遗传概况。 ATAC-Seq实验仅需要约50,000个细胞作为起始样本,且实验步骤相对较为简单,是开始表观遗传研究的一种非常高效的方法。 ATAC-Seq 实验...
ATAC测序技术原理 为了从染色体可及性中挖掘到重要转录信息,Stanford大学William J. Greenleaf团队在2013年发明了一种用DNA转座酶结合高通量测序技术的方法,即ATAC-Seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing,染色体可及性测序)。ATAC-Seq技术核心便是孵育连接测序接头的Tn5转座酶。在ATAC-Seq实验中...
ATAC-seq，全名为Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing，是由美国斯坦福大学的William Greenleaf教授于2013年所研发的全新表观遗传学研究方法。通过利用DNA转座酶结合高通量测序技术，该技术旨在研究染色体的可及性，揭示基因组中所有活跃转录的调控序列。ATAC-seq技术的创新...
什么是ATAC测序?ATAC测序(Assay for Transposase-Accessible Chromatin sequencing)是一种高通量测序技术,用于研究染色质的可及性以及操作染色质修饰与转录因子结合之间的关系。这项技术通过检测开放染色质的区域,可鉴定出基因组中可及的DNA序列。在本文中,我们将主要关注ATAC测序中与转录因子相关的应用及意义。 转录因子...
最近大火的ATAC, 究竟是干什么的 查看原文 ATAC-seq以及相关技术(DNase-seq,MNase-seq,NOMe-seq)的发展 如下: 首先,向我们了解到的,CHIP-seq即染色质免疫共沉淀质谱技术,它主要通过对已知的蛋白,通常是目的转录因子TF免疫沉淀,抓取与该TF结合的DNA片段,然后再进一步的扩增,找到TF的潜在靶基因...)消化和研究染色...
ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing,中文可理解为结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。这个方法是2013年由斯坦福大学的William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室共同开发的用于研究染色质可及性/开放性的方法。目前,通过ATAC-seq方法发表的文章数量...
首先我们来看看,ATAC-seq是什么意思? 本文的说法:Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing,简称ATAC-seq,即运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的实验。关键词:测序,转座酶可接近染色质,转座酶能接近的区域,也就是处于开放状态的区域,这也是本实验的关键所在,测序和染色质开放区域。下图...