第四步： DNA回收和纯化，即分离DNA和蛋白质之间的交联并提取清洁DNA。第五步：通过 qPCR、ChIP 测序...
纯化后,可使用barcode引物通过PCR扩增文库。所得文库随后通过qPCR或NGS进行分析。 其它ATAC-Seq注意事项 使用正确的细胞数量用于转座是很重要的。一般建议使用25,000-75,000个细胞。使用太少或太多的细胞会导致消化过度或消化不足,这会降低文库的质量。此外,细胞的固定和剧烈的机械剪切趋于降低数据质量。 最近的ATAC-S...
motif被定义为：在复杂网络中某种连接模式出现频率显著高于随机网络的现象。
ATAC-seq 属于表观组学的范畴，在表观组学中，无非就是DNA 水平甲基化，组蛋白水平修饰（Chip-seq）以...
2..ATAC-seq可以研究染色质的开放区域、转录因子印迹(footprint)和核小体的定位。主要的应用于研究细胞...
IGV IGV 可以从BROAD网站安装。 》https://www.broadinstitute.org/igv/ MACS2 MACS2[2]没有 R 包...
2）由于Tn5在ATACseq里的成功表现，Tn5的使用已被极大的扩展到ChIPseq和HiC以及两种实验的hybrid里，比如...