macs2 进行 Peak Calling 这是非常关键的一步,ATAC-seq 分析的核心结果都要从这里出,使用的是 macs2。 常用参数 macs2[-h][--version]{callpeak,bdgpeakcall,bdgbroadcall,bdgcmp,bdgopt,cmbreps,bdgdiff,filterdup,predictd,pileup,randsample,refinepeak}... -f 指定输入文件的格式,如 SAM、BAM、BED ...
macs2 进行 Peak Calling 这是非常关键的一步,ATAC-seq 分析的核心结果都要从这里出,使用的是 macs2。 常用参数 代码语言:javascript 复制 macs2[-h][--version]{callpeak,bdgpeakcall,bdgbroadcall,bdgcmp,bdgopt,cmbreps,bdgdiff,filterdup,predictd,pileup,randsample,refinepeak}... -f 指定输入文件的...
usage: macs3 [-h] [--version] {callpeak,bdgpeakcall,bdgbroadcall,bdgcmp,bdgopt,cmbreps,bdgdiff,filterdup,predictd,pileup,randsample,refinepeak,callvar,hmmratac} ... macs3: error: unrecognized arguments: -g hs -B -q 0.01 Additional context macs2 works well, but i still want to lear...
macs2 进行 Peak Calling 这是非常关键的一步,ATAC-seq 分析的核心结果都要从这里出,使用的是 macs2。 常用参数 macs2[-h][--version]{callpeak,bdgpeakcall,bdgbroadcall,bdgcmp,bdgopt,cmbreps,bdgdiff,filterdup,predictd,pileup,randsample,refinepeak}... -f 指定输入文件的格式,如 SAM、BAM、BED ...