SHARE-Seq用于大规模联合分析染色质可及性和基因表达 为了创建染色质可及性和mRNA表达共谱分析方法,作者基于SPLiT-seq和Paired-seq方法开发了SHARE-seq,使用多轮杂交封闭来唯一且同时标记同一单个细胞中的mRNA和染色质片段(图1A)。 简而言之,在SHARE-seq...
1.2.5 RNA-seq和ATAC-seq数据的关联分析 分别将DLD1和SW480两个细胞系中RNA-seq的差异基因和ATAC-seq的差异表达峰进行关联分析,得到两组关联分析结果,以明确两组细胞中染色质易接近性变化区域对下游基因的调控功能,并找出每种细胞实验组与对照组相比差异染色质易接近性区域可能调控的下游基因。 1.2.6 两个细胞系...