echo 'export PATH=~/.aspera/connect/bin:$PATH' >> ~/.zshrc source ~/.zshrc 第二种,conda编译安装(wsl我用的是这一种) conda create -n ascpdown sourece activate ascpdown conda install -c hcc aspera-cli=3.7.7 然后使用ascp下载数据 这里推荐使用EBI数据库下载,可以现在ncbi上搜索数据然后去ebi去...
conda一步到位 这时候我开始反思 为什么我花了3天在这里纠缠 而不去试一下conda conda create -n ascp conda install -c hcc aspera-cli -y ascp -h #检查安装 五分钟,解决了 但说是sra数据上传云端后ascp下载也不会快了好像,新版prefetch就不自动用ascp了 ...
001、 (base) [root@pc1 ~]#conda install -c hcc aspera-cli -y 002、调用测试 (base) [root@pc1 ~]#ascp -h | head 。
conda install -c hcc aspera-cli=3.7.7 然后使用ascp下载数据 这里推荐使用EBI数据库下载,可以现在ncbi上搜索数据然后去ebi去找对应的数据 然后点击下面的TSV,下载完成后直接拖到子系统目录下面就行 由于拖进去的文件子系统是没有任何权限的,所以要对数据添加权限 # 这个代码不要执行chmod a+wr filereport_read_...
conda install-c hcc aspera-cli-y #检查ascp是否下载成功 ascp-h 3实例演示 从NCBI-SRA下载accession list,把SRA编号,通过vim写到SRA.list里 使用ascp下载需要密匙asperaweb_id_dsa.openssh,位置在: 代码语言:javascript 复制 #我的环境名称是chip,文件路径需要自行探索: ...
可以先去百度这个APP的名字进入官网或者一些比较权威的应用下载平台(比如应用宝，360等)然后进行下载，如果以上方法找不到，可以问问提供这个app的人，让其给一个下载链接或者二维码进行下载，这样可能中病毒让手机信息被不法分子盗取，让自己的财产受到损失。可以先去百度这个APP的名字进入官网或者一些比较权威...
跨平台:ascp 工具可在多种操作系统上运行,包括 Windows、Linux 和 macOS 等主流操作系统。...命令行操作:ascp 通过命令行进行操作,提供了丰富的选项和参数,方便用户进行定制化的传输设置和管理。...list 2安装Aspera 一般推荐使用Conda安装管理软件 conda install -c hcc aspera-cli -y #检查ascp是否下载成功 ...
ascp -QT -l 300m -P33001 -i /home/data4/zhouyaqi/miniconda/conda/envs/ascpdown/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/$x/00$y/$id/ ./ done nohup sh ascp2.sh 报错: Session Stop (Error: Session data transfer timeout (server), Session data trans...
ascp -h ascp 报错 ascp:private key file not found at path image.png 找个asperaweb_id_dsa.openssh 文件复制过去即可,可以用conda安装 cp /home/xulab1/software/asperaweb_id_dsa.openssh /home/xulab1/.aspera/connect/etc/ 又出现了新问题 ascp: failed to authenticate, exiting.或者需要问我passwor...
cellcondatxt 这样的文件很明显没办法给我们跑单细胞转录组流程,看了看原文:《Single-cell RNA sequencing reveals B cell–related molecular biomarkers for Alzheimer’s disease》,其实在《单细胞天地》有它的介绍:单细胞测序揭示阿尔兹海默症的B细胞相关标志物 生信技能树 2022/03/03 2.1K0 使用aspera从EBI下载fa...