为了解析颠茄AbARF转录因子结构多样性和进化关系,结果如图2所示,AbARF蛋白由1～10个Motifs组成(图3为Motifs氨基酸分布情况),均含有B3结构域(Motif1/3/6和8),说明表明这4个基序在AbARF蛋白序列中分布最广、保守程度最高,也从侧面佐证了筛选出的41个AbARF转录因子均属于ARF基因家族成员。AbARF蛋白(除去AbARF16不...
为了解析颠茄AbARF转录因子结构多样性和进化关系,结果如图2所示,AbARF蛋白由1～10个Motifs组成(图3为Motifs氨基酸分布情况),均含有B3结构域(Motif1/3/6和8),说明表明这4个基序在AbARF蛋白序列中分布最广、保守程度最高,也从侧面佐证了筛选...
ARF 基因家族在植物生长发育中扮演重要 角色,影响植物对非生物胁迫的反应,但尚未有 研究鉴定和分析颠茄中的 ARF 基因(AbARF). 因此,我们对颠茄 ARF 基因家族进行了全基因 组鉴定和分析 ,运用最大似然法( ML)构建了系 统发育树,并使用系统发育方法将 ARF 基因分 类为不同的分支.分析了 AbARF 基因的基本组 ...
转录因子基因家族扩张是生物的普遍现象,不同家族成员的DNA识别特异性是我们理解基因冗余性和功能分化的基础。该研究大规模研究了ARF基因家族的顺式调控元件,靶基因涉及到了发育、驯化和产量等性状。本研究发现了ARF基因家族的冗余性和功能分化现象,揭示了ARF可能通过异二聚体来实现对目标靶基因的多样性调控,同时发现moti...
苹果生长素响应因子(ARF)基因家族全基因组鉴定及表达分析李慧峰*,冉昆*,何平,王海波,常源升,孙清荣,程来亮,李林光**山东省果树研究所,山东泰安271000摘要:生长素响应因子(auxinresponsefactor,ARF)基因在调控生长素响应基因和生长素信号转导途径以及其它多个生长发育过程具有重要作用。本研究利用BlastP程序比对并获得苹果...
本研究以谷子为材料,从谷子中鉴定出24个ARF基因并命名为SiARFs。利用生物信息学对谷子SiARFs基因的结构、染色体分布、基因倍增模式、系统进化以及基因的表达模式进行分析。结果表明,SiARF基因家族在染色体上不均匀的分布,在除2号染色体外的其它染色体上都有该家族基因,基因的扩增模式为分散复制与片段复制。SiARFs基因...
为进一步研究辣椒ARF(Auxin Response Factor)基因家族在其生长发育及逆境胁迫中的作用,利用生物信息学方法从辣椒基因组中鉴定出20个ARF基因,这些基因不均匀地分布在辣椒12条染色体上。进化关系显示辣椒ARF基因可分为ClassⅠ和Ⅱ两大类,进一步可细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。基因结构图表明...
1,冯红梅1,韩渊怀1,周美亮2,张凯旋 2,刘龙龙3,王俊珍4,李红英1,孙朝霞1( ) Identification of ARF Gene Family and Expression Pattern Induced by Auxin inFagopyrum tataricum HAO YanRong1( ),DU Wei1,HOU SiYu1,WANG DongHang1,FENG HongMei1,HAN YuanHuai1,ZHOU MeiLiang2,ZHANG KaiXuan2,LIU LongLong...
赵艳 1 ,瓮巧云 1 ,马海莲 1 ,宋晋辉 1 ,袁进成 1 ,王凌云 1 ,董志平 2 ,刘颖慧 1 ( 1 河北北方学院,张家口075000; 2 河北省农林科学院谷子研究所,石家庄050001) 摘要:生长素应答因子(ARF,auxinresponsefactors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的 生长发育中起至关重要的...
生长素响应因子(auxinresponsefactor,ARt)基因在调控生长素响应基因和生长素信号转导途径以及其它多个生长发育过程具有重要作用.本研究利用BlastP程序比对并获得苹果ARF基因家族,通过DNAMAN6.0,MEGA5.0,WebLogo3,Maplnspect和MEME软件对苹果4尺,基因进行分析,采用RT-PCR技术研究基因组织表达情况.结果表明,苹果基因组存在...