通过conda 快速安装已经预编译的 Ambertools: # 进入你的 python 环境,通过 conda-forge channel 安装预编译的Ambertools# conda activate YOUR_ENVconda install ambertools -c conda-forge 1. 获取源码包与解压 Amber24 目前已经非商业/学术免费,填写你的姓名和机构,从官网获取Amber24.tar.bz2&AmberTools24.tar....
一、关于国内安装Ambertools的说法和安装手段 这里先申明,Amber 官网能下载到的只有Linux系统的源码,没有Windows系统可以使用的XXX.exe的安装文件;官网也明确给出对于Windows的安装推荐使用WSL2 子系统 作为载体的方式进行安装。 Amber 官网推荐windows安装方式 载体的概念:Windows系统想要安装Linux系统的软件,那么就需要安...
配置环境变量①在Windows左下角搜索栏中，输入“环境变量”并打开。②在用户变量列表的上方，点击“新建”按钮，添加一个新的变量名：AMBERHOME（注意全部大写字母）。将变量值设置为ambertools20软件所在的具体路径。③在用户变量栏中，找到并选中“path”变量名，随后点击“编辑”按钮。在弹出的窗口中，将ambertools2...
知名的AmberTools（http://ambermd.org）程序里的leap可以用于根据氨基酸序列产生线型小肽的三维结构并...
把AmberTools和Amber两个包都下载，解压，CMakeLists.txt前面加入add_compile_definitions(THRUST_IGNORE_...
Amber docker images for molecular dynamics docker-imageamberambertools UpdatedJun 27, 2023 Shell crfield18/PhD-scripts Star2 Code Issues Pull requests A collection of scripts written for use with different computational biology/chemistry packages throughout my PhD. ...
输入tar xvfj AmberTools24.tar.bz2解压后切换至amber24_src/build文件夹,输入./run_cmake即可自动构建和安装。 在编译结束后输入make install(安装时出现不终止安装程序的warning可先不理会) 添加Amber至环境变量:source /home/xxxx/amber24/amber.sh(amber的安装目录) ...
cp: 无法获取"../../AmberTools/src/netcdf/include/*.mod" 的文件状态(stat): 没有那个文件或...
在Win10下安装Ambertools23的经验教程如下：安装WSL2：由于Amber只能在Linux系统下运行，因此需要在Windows 10上安装WSL2。可以通过搜索引擎查找并遵循相关教程来完成WSL2的安装。下载Amber安装包：访问Amber官方网站下载Ambertools23的安装包。注意网络速度可能影响下载进度，建议选择网络负载较低的时间段进行...
输入tar xvfj AmberTools24.tar.bz2解压后切换至amber24_src/build文件夹,输入./run_cmake即可自动构建和安装。 在编译结束后输入make install(安装时出现不终止安装程序的warning可先不理会) 添加Amber至环境变量:source /home/xxxx/amber24/amber.sh(amber的安装目录) ...