通过conda 快速安装已经预编译的 Ambertools: # 进入你的 python 环境,通过 conda-forge channel 安装预编译的Ambertools# conda activate YOUR_ENVconda install ambertools -c conda-forge 1. 获取源码包与解压 Amber24 目前已经非商业/学术免费,填写你的姓名和机构,从官网获取Amber24.tar.bz2&AmberTools24.tar....
需要安装 OpenMPI 或 MPICH 等 MPI 编译器。(注:AmberTools21 的文档说系统提供的(yum 安装的)不行,AmberTools22 无此要求) 0. 基础工作 假设源码压缩包存放于/home/xxxx (你的用户名)。 cd /home/xxxx tar xvfj AmberTools22.tar.bz2 tar xvfj Amber22.tar.bz2 首先安装必备的库(CentOS 8/9)。 yum...
1.依赖 参考ambermd.org 2.解压 tar xvf AmberTools20.tar.bz2&&tar xvf Amber20.tar.bz2 或者,拥有AmberTools21和Amber20 tar xvf AmberTools20.tar.bz2&&tar xvf Amber20.tar.bz2 3.升级 cd amber20_src ./update_amber --upgrade ./update_amber --update 4.编译 编译器 GNU编译器 INTEL编译器 GNU...
2. 使用conda安装Ambertools23 完成安装后,输入"antechamber"并回车,若出现相应界面,则表示安装成功。3. 使用conda安装acpype 安装版本为v. 2022.6.6,完成安装后,输入"acpype"并回车,如出现特定提示信息,则表示安装成功。
Ubuntu 下安装AMBER10/AmberTools 1.2 1 准备工作 1.1 编译前系统需要安装fortran/c编译器,csh/patch,以及flex(做语义分析的) sudo apt-get install gfortran g++ flex csh patch 如果你要用intel编译器,可能会麻烦些。新手呢,最好听从amber作者David Case的建议先用gnu的编译器 ...
这篇博文专门讲述 Ambertools15的安装方法,尽管Ambertools16版本已经正是发行了,但两者在安装方式上没有任何区别。比较偏爱Ambertools15的原因主要还是在容量方面(230M),它比Ambertools14改进了不少,但其bz2型压缩容量只增加了27M,而Ambertools16已经有330M了(这个新功能如果在以后应用中涉略较多的话,我在专门开博讨...
https://ambermd.org/GetAmber.php#ambertools mkdir -p ~/miniconda3 curlhttps://repo.anaconda....
但是官网教程的攻略都是假设我没有AmberTools的情况下一起解压编译安装的,可是因为是Mac,我现在已经用...
Win64ARMOpenSSL-Light-3-3-1.exe win64 位 ARM 芯片 OpenSSL 3.3.1 安装包 2024-12-13 20:30:33 积分:1 城堡王国场景模型:Fantasy Castles Pack 1.2 2024-12-13 20:27:06 积分:1 Win32OpenSSL-Light-3-3-1.exe win32 位 OpenSSL 3.3.1 安装包 ...
首先,我了解到Amber只能在Linux系统下以命令行方式运行,因此我需要为Windows操作系统安装WSL2(Windows Subsystem for Linux 2)。此过程可以通过搜索引擎查找相关教程来完成。接着,我访问Amber官方网站下载了安装包。下载过程中,我发现网络速度影响下载进度,建议选择在傍晚或清晨进行下载,以提高成功率。...