利用AlphaFold3预测目的蛋白与候选蛋白互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it easier,会让互作机制研究会更容易些。建议结合其他生信分析网站,如PPI、BioGRID、IntAct,ComplexPortal等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的CoIP-Mass或HuProt蛋白组芯片互作组数据(湿实验数据),进行初...
尽管如此,AlphaFold3仍可作为研究核酸-蛋白质互作的辅助工具,特别是在预测可能的互作位点方面。为提高预...
我们团队紧跟互作机制研究热点,可以协助您的项目,使用AlphaFold3工具进行预测分析。另外,我们团队长期聚焦互作机制研究的湿实验技术服务,如RIP-Seq互作组检测、RIP-qPCR互作蛋白验证、修饰互作验证、环境条件互作验证、互作调控机制探索等实验,协助您轻松突破互作机制
建议结合其他生信分析网站,如PPI、BioGRID、IntAct,ComplexPortal等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的CoIP-Mass或HuProt蛋白组芯片互作组数据(湿实验数据),进行初步分析,然后再用AlphaFold3进行预测验证,将会提高互作机制研究的成功率。 缺点:AlphaFold3毕竟是基于序列和AI大模型的建模预测,本身仅供参考。另外,真实世...
那么如何用AlphaFold3预测候选蛋白质与蛋白质互作呢? 第一步,通过Uniport网站获取候选基因的蛋白质序列(以MYC、PRMT5为例)。获取MYC蛋白质序列。 获取PRMT5的蛋白质序列。 第二步,访问 AlphaFold Server(AlphaFold Server需要科学上网,而且建议使用Google浏览器,使用谷歌账号登录)和输入数据进行预测。
AlphaFold3..专题一介绍了转录因子与靶基因启动子互作,本次介绍蛋白质与蛋白质互作预测。先上应用实操总结(同专题一总结类似,看过可忽略直接进入实操正文):优点:利用AlphaFold3预测目的蛋白与候选蛋白互作,目前
AlphaFold3..专题一介绍了转录因子与靶基因启动子互作,本次介绍蛋白质与蛋白质互作预测。先上应用实操总结(同专题一总结类似,看过可忽略直接进入实操正文):优点:利用AlphaFold3预测目的蛋白与候选蛋白互作,目前
AlphaFold3..专题一介绍了转录因子与靶基因启动子互作,本次介绍蛋白质与蛋白质互作预测。先上应用实操总结(同专题一总结类似,看过可忽略直接进入实操正文):优点:利用AlphaFold3预测目的蛋白与候选蛋白互作,目前
AlphaFold3..蛋白质与蛋白质互作是指不同蛋白质之间的相互作用,这种作用可以发生在细胞内或细胞外。蛋白质通过互相结合,形成复杂的细胞机制和信号传导网络,参与多种生物过程,如基因调控、代谢、信号传导等。这种互作是生命活
AlphaFold3实操预测蛋白质与蛋白质互作 蛋白质与蛋白质互作是指不同蛋白质之间的相互作用,这种作用可以发生在细胞内或细胞外。蛋白质通过互相结合,形成复杂的细胞机制和信号传导网络,参与多种生物过程,如基因调控、代谢、信号传导等。这种互作是生命活动中的重要组成部分,对维持生物体的正常功能具有重要意义。