ago2rip实验步骤AGO2RIP实验步骤涉及RNA提取、RNA分离、RNA标记、细胞裂解、免疫沉淀、测序文库制备和测序分析,用于研究Argonaute 2 (AGO2)蛋白与RNA结合的相互作用。©2022 Baidu |由 百度智能云 提供计算服务 | 使用百度前必读 | 文库协议 | 网站地图 | 百度营销 ...
AGO2 - RIP-Seq结果显示,通过累积分布曲线(图5A)和密度分布图(图5B)分析,与AGO2S417A相关的miRNA较与AGO2WT相关的miRNA明显减少。 根据与AGO2S417A和AGO2WT的结合能力,作者将miRNA分为低亲和组(RIP下调富集,log2 [fold change] < 0.5, RIP/input≥1)和高亲和组(RIP上调,log2 [fold change]≥0.5,RIP/...
AGO2 - RIP-Seq结果显示,通过累积分布曲线(图5A)和密度分布图(图5B)分析,与AGO2S417A相关的miRNA较与AGO2WT相关的miRNA明显减少。 根据与AGO2S417A和AGO2WT的结合能力,作者将miRNA分为低亲和组(RIP下调富集,log2 [fold change] < 0.5, RIP/input≥1)和高亲和组(RIP上调,log2 [fold change]≥0.5,RIP/...
因此,AGO2蛋白功能调节机制尤为重要,如AGO2乙酰化修饰(Oncogene 2019)和AGO2磷酸化修饰(Neoplasia 2020)等。 在此项工作中,作者首先通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测发现:低氧条件下,miRNA通路抑制,其靶标mRNA降解阻滞,进而呈现整体性累积。采用定量质谱分析表明:低氧能够促进miRNA通路核心效应分子AGO2蛋白与线性泛...
与circ_0005231具有靶向互补结合位点的mi RNAs.2.Ago2 RIP,mi R-383-5p pull down实验和双荧光素酶报告基因实验分析circ_0005231和mi R-383-5p的靶向关系.3... 孙智广 - 河北医科大学 被引量: 0发表: 2023年 EGFr-TKI治疗敏感突变型非小细胞肺癌原发耐药的血浆miRNA机制研究 结果提示miRNA可能参与EGFR-TKI...
为了解析OsAGO2参与并调控水稻抗稻瘟病的机制,作者通过RIP-sequencing 鉴定到一批与OsAGO2结合的miRNA,包括miR1875。与OsAGO2结合的miR1875可以靶标并抑制 OsHXK1 表达。OsHXK1通过传递葡萄糖信号促进ROS积累,过表达 OsHXK1 导致水稻细胞内ROS含量增多,增强了水稻抗性;而沉默 OsHXK1 则导致ROS含量减少,削弱了...
在此项工作中,作者首先通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测发现:低氧条件下,miRNA通路抑制,其靶标mRNA降解阻滞,进而呈现整体性累积。采用定量质谱分析表明:低氧能够促进miRNA通路核心效应分子AGO2蛋白与线性泛素化链组装复合物(linearubiquitin chain assembly complex, LUBAC)相互作用。LUBAC是目前发现的唯一一个介导线性...
为了解析OsAGO2参与并调控水稻抗稻瘟病的机制,作者通过RIP-sequencing 鉴定到一批与OsAGO2结合的miRNA,包括miR1875。与OsAGO2结合的miR1875可以靶标并抑制OsHXK1表达。OsHXK1通过传递葡萄糖信号促进ROS积累,过表达OsHXK1导致水稻细胞内RO...
在此项工作中,作者首先通过RIP-seq/RNA-seq/miRNA-seq检测发现:低氧条件下,miRNA通路抑制,其靶标mRNA降解阻滞,进而呈现整体性累积。采用定量质谱分析表明:低氧能够促进miRNA通路核心效应分子AGO2蛋白与线性泛素化链组装复合物(linear ubiquitin chain assembly complex,LUBAC)相互作用。LUBAC是目前发现的唯一一个介导线性...
02 RIP-seq技术简介 这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq将RIP技术与高通量测序相结合,能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA,从而解析全转录组范围内的目标蛋白-RNA相互作用网络。云序生物是业内少数的既做前端高通量测序筛选...