研究团队选取了10种具有代表性的钙钛矿氧化物,提出通过两类测试来评估UniPero的适用性:Task I - 在不同温度下进行第一性原理分子动力学(AIMD)模拟,并利用UniPero来计算AIMD轨迹构型的能量和原子力(这些AIMD轨迹未用于训练UniPero);Task II – 使用UniPero在不同温度下进行经典分子动力学模拟,并使用DFT来计算这些轨...
可以看到,在相同的模拟条件下,DeePKS-DeePMD模拟完美复现了此前SCAN0-DeePMD模拟给出的结构性质,且与SCAN0-AIMD的结果高度吻合。 氯化钠的水溶液的动力学模拟 与上述流程类似,对于纯水及不同浓度氯化钠溶液的混合体系,我们以SCAN给出的能量和力为标签训练了基于PBE的DeePKS模型并应用于DeePMD动力学模拟。结构性质...
执行AIMD:取01.scale_pert起始构象调用 vasp 执行少步数 AIMD,输出文件存储在02.md。 整理初始数据:调用dpdata提取02.md中 AIMD 各 snapshots 的数据作为初始数据,输出文件存储在02.md。 param.json中将使用stages关键词的取值 1~4 控制以上 4 步的执行,操作中,各步骤(2, 3, 4 在所需前一步输出文件存在的...
siestaaimd_outputTrueTrueLabeledSystem'siesta/aimd_output' cp2koutputFalseTrueLabeledSystem'cp2k/output' cp2kaimd_outputTrueTrueLabeledSystem'cp2k/aimd_output' QElogFalseTrueLabeledSystem'qe/pw/scf' QElogTrueFalseSystem'qe/cp/traj' QElogTrueTrueLabeledSystem'qe/cp/traj' ...
郑大也,本科和博士毕业于中国科学技术大学,导师为何力新教授。博士期间的主要工作为ABACUS软件开发和第一性原理计算应用研究。开发了AIMD、应力计算、自旋轨道耦合等功能。2021年6月博士毕业后加入AISI,任职电子结构研究员岗位,负责ABACUS软件开发、代码重构、性能调优工作。