该研究以重要药用昆虫九香虫Coridius chinensis为研究材料，在半翅目昆虫中首次描绘了A-to-I RNA编辑图谱，揭示了非同义RNA编辑位点（Nonsyn）受到的正向自然选择信号，同时鉴定到少量在不同目的昆虫中高度保守的Nonsyn编辑位点，并发现其中一些具有重要功能的位点可能参与昆虫的低温胁迫反应，帮助生物适应环境的变化。腺嘌...
首先,具有增加蛋白质组多样性潜力的ADAR编辑位点在人类癌细胞中非常罕见,在该研究中一共预测了34个高置信度的位于K562细胞的CDS区域的RNA编辑位点(图 5b,c),其中通过Sanger直接验证的只有5个基因中的9个位点(5个已注释和4个新发现位点),其中6个可以引起氨基酸变化。
陆剑课题组之前的工作已经报道了在果蝇中存在大量改变氨基酸的非同义RNA编辑位点(Nonsyn),这些编辑位点呈现出适应性信号,受到正向自然选择(Duan et al., 2017, PLoS Genetics),并且这些成簇分布的、具有适应性的非同义RNA编辑事件倾向于连锁在相同mRNA分子上,同时被编辑(Duan et al., 2018, Molecular Biology and E...
陆剑课题组之前的工作已经报道了在果蝇中存在大量改变氨基酸的非同义RNA编辑位点(Nonsyn),这些编辑位点呈现出适应性信号,受到正向自然选择(Duan et al., 2017, PLoS Genetics),并且这些成簇分布的、具有适应性的非同义RNA编辑事件倾向...
在该综述中,作者总结研究领域相关进展,探讨了ADAR基因的演化、A-to-I RNA编辑位点在后生动物中的分布和演化驱动力、非同义编辑位点的生物学意义,以及RNA编辑的趋同演化现象。 2021年5月17日,北京大学生命科学学院陆剑研究员课题组在WIREs RNA发表题为“Evolutionary driving forces of A-to-I editing in metazoans”...
禾谷镰刀菌中FgTAD2和FgTAD3的表达水平与性发育过程中的A-to-I mRNA编辑活性正相关(Fig.1b)。通过分析,发现所有鉴定的A-to-I mRNA编辑位点和tRNA的A34位点具有相似的碱基偏好性(Fig.1e)。利用RIP-seq技术,证明了FgTad2-FgTad3复合体倾向于结合被高度编辑的基因的mRNA(Fig.1f),暗示其在真菌的mRNA编辑中...
新加坡南洋理工大学Meng How Tan课题组在新研究中发现,纳米孔RNA测序可直接检测A-to-I的编辑位点。 2022年6月13日,《自然—方法学》杂志在线发表了这项成果。 研究人员介绍,肌苷是动物中普遍存在的一种RNA修饰,当腺苷被ADAR家族的酶脱氨...
这项研究首次发现RNA编辑多态性位点可能影响个体水平免疫力的强弱,以及RNA编辑作为一类RNA水平的调控方式受到平衡选择。上述研究成果已于近日在Genome Biology在线发表,题目为“Human A-to-I RNA editing SNP loci are enriched in GWAS signals for autoimmune diseases and under balancing selection”。中山大学生命科学...
在该综述中,作者总结该领域相关进展,探讨了ADAR基因的演化、A-to-I RNA编辑位点在后生动物中的分布和演化驱动力、非同义编辑位点的生物学意义,以及RNA编辑的趋同演化现象。 基因复制事件是新基因产生的重要来源。ADAR基因、tRNA编辑酶ADAT基因,以及不具编辑活性只在睾丸中表达的ADAD基因就是由一系列基因复制事件产生的...